106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2193 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  481  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  94.19 
 
 
258 aa  472  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  92.62 
 
 
230 aa  442  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  87.7 
 
 
217 aa  414  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  73.55 
 
 
222 aa  354  6.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1069  hypothetical protein  77.52 
 
 
259 aa  348  5e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  62.66 
 
 
243 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  59.66 
 
 
229 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2223  hypothetical protein  75.42 
 
 
245 aa  280  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  58.8 
 
 
230 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  58.92 
 
 
229 aa  276  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3373  hypothetical protein  71.04 
 
 
245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3374  hypothetical protein  71.04 
 
 
259 aa  269  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4438  protein of unknown function DUF820  55.08 
 
 
229 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  54 
 
 
250 aa  269  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  54 
 
 
250 aa  269  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3375  hypothetical protein  70.49 
 
 
245 aa  268  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  58.72 
 
 
232 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3372  hypothetical protein  70.65 
 
 
259 aa  265  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1536  protein of unknown function DUF820  56.95 
 
 
239 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  55.98 
 
 
248 aa  262  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  55.98 
 
 
248 aa  262  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3182  hypothetical protein  64.5 
 
 
200 aa  262  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  54.29 
 
 
260 aa  261  8.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  67.57 
 
 
265 aa  261  8.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1198  protein of unknown function DUF820  54.74 
 
 
217 aa  255  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  54.74 
 
 
217 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2576  protein of unknown function DUF820  55.17 
 
 
227 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3851  protein of unknown function DUF820  54.47 
 
 
218 aa  245  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0319  protein of unknown function DUF820  54.35 
 
 
232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191601 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  40.74 
 
 
251 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  36.4 
 
 
274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  33.47 
 
 
259 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  33.2 
 
 
231 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  32.76 
 
 
245 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  33.64 
 
 
238 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3700  hypothetical protein  57.83 
 
 
114 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  32.66 
 
 
225 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  31.13 
 
 
284 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  30.5 
 
 
252 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  35.63 
 
 
272 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  30.5 
 
 
252 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  30.5 
 
 
243 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  30.5 
 
 
243 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  32.5 
 
 
240 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  36.31 
 
 
254 aa  98.6  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  34.17 
 
 
237 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  28.33 
 
 
226 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  32.56 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  28.51 
 
 
241 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  28.51 
 
 
241 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  31.11 
 
 
254 aa  86.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  32.38 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  29.88 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  88.24 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  29.19 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  26.61 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  32 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  33.72 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  32.35 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  30.7 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  27.75 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000019093  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  28.29 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3834  hypothetical protein  36.09 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1345  protein of unknown function DUF820  33.79 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.05834  unclonable  0.00000000208542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0796  hypothetical protein  38.31 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  33.96 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3222  protein of unknown function DUF820  27.63 
 
 
227 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  31.36 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3884  hypothetical protein  35.5 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5551  protein of unknown function DUF820  24.51 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.540442 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  35.16 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2233  protein of unknown function DUF820  30.27 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0797  hypothetical protein  36.04 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.530617  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  28.14 
 
 
252 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1875  hypothetical protein  28.23 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.631797  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2476  protein of unknown function DUF820  29.71 
 
 
259 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  28.02 
 
 
260 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2553  hypothetical protein  27.14 
 
 
248 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1743  hypothetical protein  30.8 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311817  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0800  protein of unknown function DUF820  27.59 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0590  protein of unknown function DUF820  32.35 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  27 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000133784  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0420  hypothetical protein  29.67 
 
 
236 aa  52  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2812  hypothetical protein  36.18 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00715038  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  53.49 
 
 
200 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  27.38 
 
 
257 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  47.92 
 
 
195 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  44.44 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  27.96 
 
 
319 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  24.17 
 
 
319 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4546  protein of unknown function DUF820  70 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  30.83 
 
 
302 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  36.67 
 
 
189 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2963  protein of unknown function DUF820  32.47 
 
 
153 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  31.25 
 
 
193 aa  43.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  31.51 
 
 
187 aa  42.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  48.98 
 
 
207 aa  42.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  33.85 
 
 
190 aa  42.4  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  31.65 
 
 
191 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>