More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0740 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  39.74 
 
 		 830 aa  635    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 832 aa  1686    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  68.26 
 
 		 835 aa  1187    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  41.66 
 
 		 827 aa  692    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  41.45 
 
 		 832 aa  680    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  42.87 
 
 		 842 aa  678    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  41.38 
 
 		 840 aa  653    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.01 
 
 		 842 aa  650    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  40.84 
 
 		 833 aa  661    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  96.51 
 
 		 832 aa  1646    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  40.02 
 
 		 842 aa  635    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  40.98 
 
 		 843 aa  653    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  41.45 
 
 		 834 aa  645    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  40.48 
 
 		 827 aa  648    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  40.46 
 
 		 841 aa  643    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  69.83 
 
 		 830 aa  1219    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  39.76 
 
 		 816 aa  635    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  40 
 
 		 828 aa  630  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  39.19 
 
 		 836 aa  629  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  39.86 
 
 		 835 aa  624  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  39.73 
 
 		 836 aa  620  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  39.81 
 
 		 836 aa  619  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  39.33 
 
 		 841 aa  620  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  39.73 
 
 		 835 aa  621  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  42.01 
 
 		 818 aa  621  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  40.05 
 
 		 828 aa  619  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  39.2 
 
 		 836 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  39.45 
 
 		 835 aa  610  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  39.86 
 
 		 843 aa  612  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  39.45 
 
 		 828 aa  611  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  39.62 
 
 		 842 aa  606  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  37.8 
 
 		 820 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  37.05 
 
 		 810 aa  588  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  38.62 
 
 		 820 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  37.14 
 
 		 818 aa  565  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  36.92 
 
 		 837 aa  559  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  38.98 
 
 		 833 aa  560  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  36.35 
 
 		 828 aa  531  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  38.29 
 
 		 821 aa  530  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  32.81 
 
 		 854 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  32.2 
 
 		 776 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  31.35 
 
 		 785 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  35.59 
 
 		 784 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  35.59 
 
 		 784 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.59 
 
 		 784 aa  392  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.59 
 
 		 784 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  35.59 
 
 		 784 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  35.07 
 
 		 784 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  33.94 
 
 		 784 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  35.07 
 
 		 784 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  34.72 
 
 		 784 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  38.06 
 
 		 712 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  34.55 
 
 		 784 aa  379  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  41.37 
 
 		 370 aa  303  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  41.1 
 
 		 370 aa  296  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  36.22 
 
 		 392 aa  269  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  37.01 
 
 		 399 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  36.49 
 
 		 370 aa  267  7e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  36.21 
 
 		 361 aa  265  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  35.93 
 
 		 361 aa  261  4e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  35.65 
 
 		 361 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  36.97 
 
 		 392 aa  260  9e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  38.83 
 
 		 343 aa  256  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  34.12 
 
 		 392 aa  245  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  34.1 
 
 		 387 aa  240  9e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  33.24 
 
 		 387 aa  239  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  38.63 
 
 		 366 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  39.88 
 
 		 346 aa  238  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  38.44 
 
 		 347 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  34.84 
 
 		 387 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  39.88 
 
 		 347 aa  233  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  35.76 
 
 		 349 aa  232  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  38.42 
 
 		 367 aa  232  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  35.08 
 
 		 348 aa  226  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  36.29 
 
 		 381 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  39.75 
 
 		 329 aa  224  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  39.36 
 
 		 392 aa  224  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  37.04 
 
 		 389 aa  221  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  38.01 
 
 		 389 aa  221  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  38.66 
 
 		 392 aa  221  5e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.72 
 
 		 392 aa  221  6e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.72 
 
 		 392 aa  221  6e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  39.36 
 
 		 392 aa  220  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.79 
 
 		 392 aa  219  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  38.19 
 
 		 392 aa  219  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  38.08 
 
 		 392 aa  217  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.9 
 
 		 392 aa  216  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  36.71 
 
 		 388 aa  216  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.61 
 
 		 392 aa  214  7e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  36.08 
 
 		 389 aa  212  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  32.98 
 
 		 357 aa  210  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  33.15 
 
 		 359 aa  206  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  33.88 
 
 		 359 aa  205  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  32.52 
 
 		 363 aa  203  8e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  32.79 
 
 		 370 aa  203  9e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  34.94 
 
 		 388 aa  201  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  34.47 
 
 		 388 aa  201  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  34.47 
 
 		 388 aa  201  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  35.38 
 
 		 359 aa  200  9e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  32.79 
 
 		 359 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>