113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0778 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  81.9 
 
 		 221 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  82.35 
 
 		 221 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  50 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  42.86 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  43.72 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  40.49 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  40.38 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  40.76 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  45.1 
 
 		 210 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  46.23 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  40 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  45.81 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  44.83 
 
 		 212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  44.83 
 
 		 210 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  44.62 
 
 		 200 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  42.36 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  46.23 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  45.03 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  33.82 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  44.5 
 
 		 199 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  33.8 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  31.4 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  30.92 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  33.81 
 
 		 259 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  30.69 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  29.7 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  31.34 
 
 		 242 aa  98.6  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  31.35 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  31.05 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  29.59 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  27.94 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  29.72 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  32.51 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  32.86 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  31.18 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  27.4 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  30.15 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  26.73 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  27.04 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  26.21 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  26.7 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  26.53 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  30.94 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  30.77 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  31.61 
 
 		 242 aa  72  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  31.68 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  26.67 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  30.73 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  27.78 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  31.68 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  25.27 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  31.84 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  28.04 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  23.53 
 
 		 328 aa  62  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  30.37 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  22.39 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  33.33 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  30.2 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  26.41 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  27.04 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  30.21 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  27.27 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  25.39 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  29.17 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  23.68 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  27.78 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0485  DSBA oxidoreductase  25.52 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  27.89 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  25.23 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  25.23 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  26.18 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  29.31 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  25.44 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  24.24 
 
 		 215 aa  48.5  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  29.74 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2566  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  40 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  25.65 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  26.96 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  25.65 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  25.65 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  24.24 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  23.24 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 225 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  27.09 
 
 		 234 aa  45.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  26.2 
 
 		 230 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8729  putative DsbA-like thioredoxin protein  30.17 
 
 		 221 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  22.22 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0131  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>