47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0086 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0086  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  352  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1722  hypothetical protein  98.29 
 
 		 175 aa  346  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1675  hypothetical protein  69.32 
 
 		 176 aa  229  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0934134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0961  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.44 
 
 		 155 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4409  hypothetical protein  41.79 
 
 		 175 aa  117  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2668  hypothetical protein  39.39 
 
 		 176 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1535  hypothetical protein  37.93 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.418999  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5601  hypothetical protein  34.73 
 
 		 168 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.971581  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0914  hypothetical protein  40.88 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0521  hypothetical protein  36.91 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3132  hypothetical protein  36.55 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2384  hypothetical protein  35.76 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0064  hypothetical protein  36.04 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00060183  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1061  hypothetical protein  34.21 
 
 		 171 aa  89.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2875  oxidoreductase molybdopterin binding  33.91 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1522  hypothetical protein  30.99 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3313  hypothetical protein  34.67 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4742  hypothetical protein  33.91 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0657446  normal  0.278144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3123  hypothetical protein  29.68 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06930  hypothetical protein  33.93 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4053  hypothetical protein  36.21 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000931  hypothetical protein  27.94 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2285  hypothetical protein  34.21 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0709741  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4734  oxidoreductase molybdopterin binding  34.38 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26980  hypothetical protein  31.16 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0783  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  31.88 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0795  hypothetical protein  31.88 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0956  hypothetical protein  31.88 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0634  hypothetical protein  30.22 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5221  oxidoreductase molybdopterin binding  30.94 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4898  hypothetical protein  35.54 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0558894 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0101  oxidoreductase molybdopterin binding  27.54 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.242171  normal  0.468495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3303  oxidoreductase molybdopterin binding  28.06 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482013  decreased coverage  0.00329734 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4147  oxidoreductase molybdopterin binding  28.06 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0617106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3369  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.06 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0496244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4799  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.06 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3349  oxidoreductase molybdopterin binding  29.66 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000852363 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2887  hypothetical protein  28.26 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5146  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.06 
 
 		 166 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6601  hypothetical protein  35.25 
 
 		 198 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1655  hypothetical protein  28.57 
 
 		 195 aa  48.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0917  hypothetical protein  31.31 
 
 		 200 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4633  hypothetical protein  27.11 
 
 		 198 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.381896 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1559  hypothetical protein  28.99 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.759066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3572  hypothetical protein  27.11 
 
 		 196 aa  42.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1772  hypothetical protein  27.54 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421289  hitchhiker  0.00000126753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0323  oxidoreductase molybdopterin binding  30.33 
 
 		 229 aa  40.8  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204614  normal  0.422647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>