68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2501 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  90.57 
 
 		 371 aa  669    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  731    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2789  hypothetical protein  78.59 
 
 		 372 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2812  hypothetical protein  69.66 
 
 		 363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0873158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  58.58 
 
 		 367 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  60.8 
 
 		 364 aa  428  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0661  hypothetical protein  33.71 
 
 		 361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.238233  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1375  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  233  5e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0582  hypothetical protein  33.71 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0149  hypothetical protein  38.66 
 
 		 375 aa  229  7e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0138  hypothetical protein  38.95 
 
 		 375 aa  212  7.999999999999999e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0479408  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0118  hypothetical protein  37.71 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  32.56 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  35.62 
 
 		 650 aa  97.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  35.29 
 
 		 534 aa  80.1  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  36.36 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3840  hypothetical protein  28.9 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  28.67 
 
 		 632 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1493  hypothetical protein  28.67 
 
 		 632 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00418774  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4168  hypothetical protein  28.83 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  32.21 
 
 		 691 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4048  hypothetical protein  26.42 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0517  hypothetical protein  26.13 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  27.63 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  35.96 
 
 		 552 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  33.33 
 
 		 695 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  33.33 
 
 		 695 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  33.33 
 
 		 695 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  33.33 
 
 		 695 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  33.33 
 
 		 695 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  32.72 
 
 		 695 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  30.08 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.09 
 
 		 746 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2067  hypothetical protein  29.56 
 
 		 638 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012683  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  31.51 
 
 		 696 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  32.35 
 
 		 706 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  29.45 
 
 		 631 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  32.35 
 
 		 706 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  32.35 
 
 		 706 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2315  hypothetical protein  27.84 
 
 		 609 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  32 
 
 		 717 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  30.46 
 
 		 717 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1143  hypothetical protein  26.57 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0290  hypothetical protein  23.75 
 
 		 351 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  27.63 
 
 		 740 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  31.21 
 
 		 700 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  31.21 
 
 		 699 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  32.43 
 
 		 450 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2466  hypothetical protein  29.41 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  31.91 
 
 		 725 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3640  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.66 
 
 		 696 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149202 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  27.66 
 
 		 700 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  27.66 
 
 		 696 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.66 
 
 		 696 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  27.66 
 
 		 696 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.66 
 
 		 696 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  27.66 
 
 		 700 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.66 
 
 		 696 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  27.66 
 
 		 696 aa  46.2  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  31.01 
 
 		 600 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  32.21 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01106  hypothetical protein  30.22 
 
 		 680 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2059  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.05 
 
 		 657 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000771664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3465  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.07 
 
 		 660 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.487354  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  30.88 
 
 		 733 aa  43.9  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1850  hypothetical protein  27.97 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.245812  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.81 
 
 		 719 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1312  hypothetical protein  32.17 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>