27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0290 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0290  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  677    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0517  hypothetical protein  75.29 
 
 
363 aa  501  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3199  hypothetical protein  44.54 
 
 
345 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3840  hypothetical protein  33.99 
 
 
376 aa  162  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4048  hypothetical protein  36.9 
 
 
358 aa  159  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  36.52 
 
 
369 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4168  hypothetical protein  26.39 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2315  hypothetical protein  38.06 
 
 
609 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  35.29 
 
 
534 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  38.24 
 
 
375 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  25.95 
 
 
364 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  24.7 
 
 
371 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  33.58 
 
 
379 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  36.23 
 
 
552 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  33.33 
 
 
691 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  33.61 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  21.93 
 
 
650 aa  56.6  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  38.52 
 
 
450 aa  56.2  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  22.48 
 
 
371 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  24.38 
 
 
632 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  21.1 
 
 
367 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1493  hypothetical protein  24.38 
 
 
632 aa  50.1  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00418774  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.56 
 
 
746 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  31.61 
 
 
727 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  31.61 
 
 
727 aa  43.9  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2812  hypothetical protein  23.17 
 
 
363 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0873158  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1375  hypothetical protein  21.63 
 
 
361 aa  42.7  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>