47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3840 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3840  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  732    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4048  hypothetical protein  72.73 
 
 
358 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0517  hypothetical protein  38.87 
 
 
363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  38.24 
 
 
369 aa  167  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0290  hypothetical protein  35.34 
 
 
351 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3199  hypothetical protein  35.69 
 
 
345 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  27.93 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  28.43 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  29.18 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4168  hypothetical protein  26.89 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  36.55 
 
 
534 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  24.72 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  39.23 
 
 
552 aa  66.2  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  36.75 
 
 
379 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  31.76 
 
 
375 aa  63.5  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  27.45 
 
 
357 aa  60.1  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.28 
 
 
746 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2812  hypothetical protein  27.54 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0873158  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  33.05 
 
 
691 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3567  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  31.75 
 
 
746 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  38.79 
 
 
450 aa  54.3  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1375  hypothetical protein  23.87 
 
 
361 aa  53.5  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2315  hypothetical protein  35.46 
 
 
609 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2789  hypothetical protein  26.23 
 
 
372 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0661  hypothetical protein  23.26 
 
 
361 aa  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.238233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1312  hypothetical protein  38.26 
 
 
375 aa  49.7  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0582  hypothetical protein  23.26 
 
 
361 aa  49.7  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2586  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  32.97 
 
 
651 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2534  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  32.97 
 
 
651 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0149  hypothetical protein  25.95 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.83 
 
 
719 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  26.27 
 
 
650 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2243  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  33.58 
 
 
768 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  hitchhiker  0.00000657541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.78 
 
 
738 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  28.47 
 
 
740 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.82 
 
 
746 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1365  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  34.35 
 
 
744 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.78 
 
 
738 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.46 
 
 
851 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  27.69 
 
 
883 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6606  hypothetical protein  33.57 
 
 
638 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213555  normal  0.251214 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2067  hypothetical protein  25.78 
 
 
638 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012683  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2587  hypothetical protein  33.33 
 
 
638 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.121215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  32.05 
 
 
631 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.92 
 
 
806 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  25.19 
 
 
758 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0138  hypothetical protein  29.37 
 
 
375 aa  43.1  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0479408  normal  0.0468167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>