32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1312 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1312  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  696    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  37.14 
 
 		 379 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  33.55 
 
 		 375 aa  109  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  26.7 
 
 		 371 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  32.41 
 
 		 450 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4168  hypothetical protein  29.65 
 
 		 367 aa  90.5  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  29.65 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  26.25 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  28.39 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0517  hypothetical protein  27.16 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3840  hypothetical protein  28.75 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  23.28 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0149  hypothetical protein  30.25 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2812  hypothetical protein  26.33 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0873158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2789  hypothetical protein  26.24 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  32.91 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  29.5 
 
 		 650 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  32.79 
 
 		 691 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0290  hypothetical protein  26.84 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0138  hypothetical protein  24.48 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0479408  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4048  hypothetical protein  27.63 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2315  hypothetical protein  34.25 
 
 		 609 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  34.93 
 
 		 534 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  28.57 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1375  hypothetical protein  19.89 
 
 		 361 aa  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  27.56 
 
 		 632 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1493  hypothetical protein  27.56 
 
 		 632 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00418774  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2466  hypothetical protein  28.95 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  33.61 
 
 		 600 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0661  hypothetical protein  20.17 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.238233  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0582  hypothetical protein  20.47 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0570  hypothetical protein  35.29 
 
 		 359 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>