More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3513 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 143 aa  289  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  72.5 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  57.98 
 
 		 263 aa  131  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1349  thioesterase superfamily protein  60 
 
 		 133 aa  130  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  50.85 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  49.21 
 
 		 265 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  48.28 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  50.43 
 
 		 260 aa  119  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  50.83 
 
 		 176 aa  118  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  51.28 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  51.28 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  46.55 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  46.55 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  49.57 
 
 		 139 aa  113  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  46.77 
 
 		 136 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  44.54 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  45.69 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  45.69 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  43.7 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  44.07 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  44.07 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  44.07 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  44.07 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  42.97 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  48.78 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  43.7 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  43.7 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  43.1 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 		 135 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 		 135 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  45.22 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  40.83 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  42.61 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  49.14 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  42.86 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6483  thioesterase superfamily protein  45.22 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.474329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  46.28 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  40.34 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  45.69 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  41.38 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  42.24 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1351  LysR, substrate-binding  68.18 
 
 		 230 aa  95.9  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  40.71 
 
 		 164 aa  90.9  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5863  thioesterase superfamily protein  47.46 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  38.58 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  39.66 
 
 		 172 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  40.18 
 
 		 185 aa  87  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 		 178 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  39.66 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 167 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 167 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3244  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 		 168 aa  84.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0288964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3071  thioesterase superfamily protein  42.48 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1190  thioesterase superfamily protein  42.48 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  38.6 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  33.61 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  34.88 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  38.02 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  37.61 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3521  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.761017  normal  0.0424383 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.89 
 
 		 171 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  36.89 
 
 		 171 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  36.89 
 
 		 171 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.89 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.89 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  38.79 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.89 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  37.27 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  32.79 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  36 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  32.79 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  42.59 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  34.86 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.68115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>