More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1918 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1918  methyltransferase type 11  100 
 
 		 229 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  73.6 
 
 		 205 aa  307  8e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  69.57 
 
 		 208 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  60.49 
 
 		 208 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3983  hypothetical protein  56.04 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.117251  normal  0.595141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4215  methyltransferase type 12  59.02 
 
 		 208 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.515794  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.14 
 
 		 212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  37.8 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2658  methyltransferase type 12  43.12 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774781  normal  0.0322757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  32.29 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  38.73 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  35.86 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  32.62 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0761  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.818805 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 252 aa  62  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  34.65 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04590  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.59 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.886413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  27.89 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.85 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  29.41 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  30.56 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  28.47 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  28.47 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  36.97 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  29.7 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  32.18 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 263 aa  54.3  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 263 aa  54.3  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 263 aa  54.3  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  28.8 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  33.12 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  32.7 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  37 
 
 		 270 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 328 aa  53.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.37 
 
 		 254 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.53 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  34.69 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.8 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  27.21 
 
 		 269 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  26.58 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 202 aa  52.4  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  27.21 
 
 		 269 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  28.57 
 
 		 1835 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1665  polyketide synthase, putative  35.19 
 
 		 4649 aa  52  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2551  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4887  methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 236 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 254 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.21 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  32.19 
 
 		 331 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  26.53 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  26.53 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  26.53 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  34.56 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  26.53 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.81 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  26.53 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1674  polyketide synthase  37.96 
 
 		 5628 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  28.57 
 
 		 400 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  25.97 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  27.7 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  33.64 
 
 		 474 aa  50.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  33.95 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3569  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1091  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.36 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 269 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  37 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>