More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0382 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.63 
 
 		 830 aa  686    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0705844  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0045  histidine kinase  72.51 
 
 		 838 aa  1252    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4896  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 		 842 aa  651    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0588  histidine kinase  44.51 
 
 		 903 aa  651    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0624  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  72.43 
 
 		 837 aa  1218    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0348163  normal  0.542065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4432  ATPase domain-containing protein  46.26 
 
 		 846 aa  649    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.645763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 843 aa  1713    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 857 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485802  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0742  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.95 
 
 		 862 aa  647    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0207  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  74.17 
 
 		 837 aa  1256    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749864  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  73.22 
 
 		 838 aa  1209    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0085  putative sensor histidine kinase  70.23 
 
 		 835 aa  1162    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0082  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  72.39 
 
 		 837 aa  1224    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0667  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.01 
 
 		 859 aa  661    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.97 
 
 		 830 aa  667    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.919247  hitchhiker  0.00131243 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3577  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 		 843 aa  599  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0821  histidine kinase  42.39 
 
 		 858 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2099  sensory box histidine kinase, putative  40.05 
 
 		 859 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2016  putative sensory box histidine kinase  41.95 
 
 		 837 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377194  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3246  histidine kinase  39.95 
 
 		 826 aa  565  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 		 861 aa  560  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.235165  normal  0.571653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4290  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 		 861 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731111  normal  0.889005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3963  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 861 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3296  histidine kinase  46.91 
 
 		 837 aa  551  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.584314 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0050  two component sensor kinase  37.82 
 
 		 911 aa  549  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1354  sensor histidine kinase  32.96 
 
 		 824 aa  467  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 829 aa  424  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.572947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3443  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 801 aa  382  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 770 aa  362  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 782 aa  329  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0262543  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2675  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 798 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 		 787 aa  286  9e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.842242  normal  0.67921 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 582 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1586  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 442 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1611  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 442 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 646 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  36.22 
 
 		 773 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 456 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  38.63 
 
 		 508 aa  164  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  32.45 
 
 		 576 aa  163  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 769 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  29.86 
 
 		 771 aa  162  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 770 aa  161  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 		 1131 aa  160  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 573 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 763 aa  159  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 568 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 784 aa  159  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  30.48 
 
 		 617 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 911 aa  158  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 875 aa  158  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.77 
 
 		 687 aa  158  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  35.56 
 
 		 603 aa  157  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 774 aa  157  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  33.88 
 
 		 729 aa  157  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 1046 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1168  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 676 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  34.25 
 
 		 771 aa  156  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  34.07 
 
 		 774 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 778 aa  155  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  38.03 
 
 		 783 aa  154  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.45 
 
 		 1126 aa  154  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  36.8 
 
 		 810 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  38.03 
 
 		 783 aa  154  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  35.85 
 
 		 461 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  34.8 
 
 		 576 aa  154  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  36.23 
 
 		 461 aa  154  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 		 704 aa  154  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 		 754 aa  154  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  36.23 
 
 		 461 aa  154  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 779 aa  153  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  28.06 
 
 		 537 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 613 aa  153  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 523 aa  153  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 600 aa  153  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 1352 aa  152  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 592 aa  152  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 614 aa  152  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  32.49 
 
 		 548 aa  151  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 853 aa  151  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0768  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 383 aa  150  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 		 738 aa  150  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 970 aa  150  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 775 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 371 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 1499 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  30.87 
 
 		 762 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.11 
 
 		 1977 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 906 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 775 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 1326 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  36.56 
 
 		 565 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0054  histidine kinase  42.35 
 
 		 215 aa  149  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.666913 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 		 510 aa  149  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  34.13 
 
 		 910 aa  149  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 856 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08080  signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 569 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.672311  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  33.58 
 
 		 629 aa  148  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  34.77 
 
 		 1137 aa  148  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  39.22 
 
 		 464 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>