More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0072 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  100 
 
 
289 aa  547  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  80.88 
 
 
292 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  72.63 
 
 
289 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  68.66 
 
 
291 aa  348  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  65.26 
 
 
317 aa  320  2e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  63.48 
 
 
295 aa  315  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  64.29 
 
 
298 aa  306  2e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  56.2 
 
 
295 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  52.45 
 
 
286 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  52.79 
 
 
325 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  54.07 
 
 
299 aa  214  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.17 
 
 
296 aa  214  2e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.43 
 
 
286 aa  213  3e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  56.27 
 
 
299 aa  211  8e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  49.21 
 
 
286 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.24 
 
 
283 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  50.9 
 
 
283 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  45.88 
 
 
283 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.57 
 
 
306 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  51.94 
 
 
296 aa  201  2e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  46.64 
 
 
287 aa  200  2e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0893  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  54.04 
 
 
296 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615942  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  51.24 
 
 
296 aa  198  8e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  48.04 
 
 
292 aa  195  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.57 
 
 
285 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  44.19 
 
 
289 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  47.99 
 
 
288 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  38.43 
 
 
288 aa  192  4e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  47.69 
 
 
275 aa  190  3e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  49.41 
 
 
293 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  41.04 
 
 
289 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  46.83 
 
 
319 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  44.73 
 
 
274 aa  183  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  44.56 
 
 
287 aa  182  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  46.07 
 
 
288 aa  182  8e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  37.41 
 
 
302 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.09 
 
 
293 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  47.6 
 
 
278 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  42.63 
 
 
289 aa  174  1e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  7.87039e-08  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  37.81 
 
 
285 aa  172  6e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  42.8 
 
 
278 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  40.44 
 
 
297 aa  170  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  3.02756e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  49.77 
 
 
274 aa  170  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.75 
 
 
286 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  39.79 
 
 
284 aa  166  6e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  39.45 
 
 
284 aa  165  1e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  43.46 
 
 
295 aa  164  1e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  45.35 
 
 
283 aa  164  2e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  39.68 
 
 
297 aa  164  2e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.27 
 
 
283 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  40.33 
 
 
279 aa  162  5e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  43.48 
 
 
280 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  41.99 
 
 
285 aa  162  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  37.87 
 
 
587 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  38.38 
 
 
285 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  44.27 
 
 
280 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  37.87 
 
 
587 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  2.99232e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  37.72 
 
 
277 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.76405e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  39.26 
 
 
283 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  39.3 
 
 
293 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  39.37 
 
 
285 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  38.16 
 
 
279 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  37.37 
 
 
277 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  43.89 
 
 
280 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  38.81 
 
 
284 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.5 
 
 
287 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.92458e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  38.68 
 
 
288 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  47.88 
 
 
278 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  39.85 
 
 
289 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  40.68 
 
 
276 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.65 
 
 
288 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  39.3 
 
 
279 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.16 
 
 
280 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1015  HemK family modification methylase  50.36 
 
 
280 aa  153  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  38.18 
 
 
284 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  35.27 
 
 
297 aa  153  3e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  37.96 
 
 
295 aa  153  3e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  38.75 
 
 
296 aa  153  3e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2871  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.67 
 
 
321 aa  153  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  1.02093e-12  hitchhiker  9.56396e-11 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  37.77 
 
 
280 aa  152  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0503  hemK protein  44.03 
 
 
285 aa  152  6e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0677  methyltransferase, HemK family protein  44.03 
 
 
285 aa  152  6e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1944  protein hemK  44.03 
 
 
285 aa  152  6e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  41.44 
 
 
285 aa  152  6e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  44.03 
 
 
285 aa  152  6e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  40.16 
 
 
277 aa  152  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3615  protein hemK  44.03 
 
 
285 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3591  putative protein hemK  44.03 
 
 
285 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.05 
 
 
280 aa  152  9e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  35.98 
 
 
279 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  43.61 
 
 
311 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.44 
 
 
289 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  42.05 
 
 
280 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.21 
 
 
279 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  6.13381e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.16 
 
 
280 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  42.64 
 
 
284 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3604  protein methyltransferase HemK  43.66 
 
 
285 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40 
 
 
277 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40 
 
 
277 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40 
 
 
277 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>