More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3811 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 99 aa  201  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 99 aa  201  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  76.6 
 
 		 97 aa  148  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  76.84 
 
 		 97 aa  145  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  76.84 
 
 		 97 aa  145  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  76.84 
 
 		 97 aa  145  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  66.33 
 
 		 99 aa  135  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  68.09 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  68.09 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  68.09 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  68.09 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  68.09 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  68.09 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  68.09 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  68.09 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  68.09 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  68.09 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  68.09 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  68.09 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  68.09 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  68.09 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  68.09 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  68.09 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  68.09 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  68.09 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  68.09 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  68.09 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  68.09 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2525  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 		 80 aa  121  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3877  transposase IS3/IS911 family protein  73.75 
 
 		 80 aa  117  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419535  normal  0.0317829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2764  transposase IS3/IS911 family protein  73.75 
 
 		 80 aa  117  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0267308  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  64.84 
 
 		 101 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  61.96 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  61.96 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  61.96 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  61.96 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  61.96 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  61.96 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  61.96 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5328  transposase IS3/IS911 family protein  52.08 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0627  transposase IS3/IS911 family protein  52.08 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5188  transposase IS3/IS911 family protein  52.08 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0746115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0282  ISMca2, transposase, OrfA  52.08 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0906  ISMca2, transposase, OrfA  52.08 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.252803  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0579  ISRSO8-transposase orfA protein  53.66 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1550  ISRSO8-transposase orfA protein  53.66 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2268  ISRSO8-transposase orfA protein  53.66 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0547  ISRSO8-transposase orfA protein  53.66 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  50 
 
 		 92 aa  83.6  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0674  putative transposase  53.49 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.635959 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4891  transposase IS3/IS911 family protein  55.26 
 
 		 97 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4962  transposase IS3/IS911 family protein  55.26 
 
 		 97 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  48.91 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  48.39 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  48.35 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  48.35 
 
 		 102 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  48.35 
 
 		 102 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  45.36 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  48.35 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  45.16 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  45.16 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  45.16 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  45.16 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  45.16 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  48.35 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  48.35 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  46.39 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  45.26 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  45.16 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  45.26 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  46.67 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 		 93 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  49.45 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  44.09 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  44.09 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  44.09 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  42.7 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  42.7 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  42.7 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  42.7 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  42.7 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  42.7 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  46.67 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  46.67 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  45.56 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  45.56 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  45.56 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  45.56 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  45.56 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  45.65 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  45.65 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  45.65 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  45.56 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  45.56 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  45.56 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  45.56 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>