More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0936 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
382 aa  784  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  44.21 
 
 
380 aa  306  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  37.28 
 
 
371 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  36.24 
 
 
381 aa  206  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  39.51 
 
 
384 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
380 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  35.44 
 
 
398 aa  188  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  31.99 
 
 
381 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  31.72 
 
 
380 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  37.46 
 
 
382 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
377 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
387 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
387 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  35.52 
 
 
374 aa  175  9e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
381 aa  176  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  37.15 
 
 
431 aa  173  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  9.53773e-05 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  31.27 
 
 
381 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 
386 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
374 aa  169  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
434 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  36.73 
 
 
370 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  38.1 
 
 
375 aa  167  3e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
428 aa  166  8e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  36.68 
 
 
417 aa  166  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 
371 aa  165  1e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 
374 aa  165  1e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 
366 aa  162  9e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  37.36 
 
 
375 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
437 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 
395 aa  161  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
393 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
435 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  37.54 
 
 
382 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 
397 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
366 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 
360 aa  158  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  35.27 
 
 
370 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
370 aa  156  5e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 
435 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
394 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  34.02 
 
 
376 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
385 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
384 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  36.9 
 
 
381 aa  155  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  31.41 
 
 
374 aa  154  3e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  29.47 
 
 
375 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
371 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.12819e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
375 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  28.98 
 
 
430 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  27.81 
 
 
375 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
395 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.69 
 
 
364 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
1089 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.16 
 
 
414 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.16 
 
 
361 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  36.16 
 
 
361 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
400 aa  149  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.16 
 
 
414 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.16 
 
 
414 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.16 
 
 
414 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.16 
 
 
401 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
398 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  37.99 
 
 
390 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  32.25 
 
 
351 aa  149  1e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
389 aa  148  2e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
384 aa  148  2e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
378 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  36.9 
 
 
340 aa  147  4e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
378 aa  147  4e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 
1261 aa  145  9e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1333  glycosyl transferase, group 1 family protein, putative  34.71 
 
 
343 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  37.54 
 
 
373 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  35.46 
 
 
423 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  31.99 
 
 
369 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
368 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
378 aa  144  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 
442 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 
372 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  29.65 
 
 
372 aa  142  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 
443 aa  142  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 
383 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  1.99281e-05 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 
408 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3491  glycosyl transferase, group 1  37.3 
 
 
440 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76367  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
361 aa  142  1e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
372 aa  142  1e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
420 aa  141  2e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  29.65 
 
 
372 aa  141  2e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  33.56 
 
 
382 aa  141  2e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 
394 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 
346 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  33.97 
 
 
346 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
363 aa  140  6e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
381 aa  139  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 
464 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 
390 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 
394 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
378 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
355 aa  136  6e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
376 aa  135  1e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
1398 aa  135  1e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>