298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2113 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  100 
 
 
270 aa  541  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  90.74 
 
 
270 aa  493  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  62.2 
 
 
266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  51.87 
 
 
219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  46.77 
 
 
223 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  49.72 
 
 
223 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  42.72 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  43.88 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  42.41 
 
 
226 aa  162  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  42.65 
 
 
240 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  41.3 
 
 
234 aa  152  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  45 
 
 
240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  43.88 
 
 
202 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  41.94 
 
 
201 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.5 
 
 
204 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  41.99 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  35.8 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.62 
 
 
227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  45.51 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  43.08 
 
 
204 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  42.47 
 
 
213 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  41.29 
 
 
216 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  40.32 
 
 
214 aa  145  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.01 
 
 
211 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  41.29 
 
 
216 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  42.46 
 
 
248 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  40.82 
 
 
218 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  41.71 
 
 
251 aa  142  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.66 
 
 
226 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  41.38 
 
 
249 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  38.42 
 
 
222 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  38.66 
 
 
222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  39.2 
 
 
241 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  40.21 
 
 
198 aa  135  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  39.2 
 
 
241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  38.8 
 
 
208 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  38.3 
 
 
201 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  38.3 
 
 
201 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  38.86 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  38.83 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  37.77 
 
 
201 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  37.43 
 
 
201 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  40.33 
 
 
216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  35.47 
 
 
224 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  36.7 
 
 
201 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  40.66 
 
 
184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  37.63 
 
 
239 aa  132  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.11 
 
 
184 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  37.57 
 
 
205 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  39.56 
 
 
224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1881  lipolytic protein  40.66 
 
 
226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0892024  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  38.46 
 
 
214 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  37.36 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  36.36 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  37.99 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  40.53 
 
 
209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  36.36 
 
 
201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  37.91 
 
 
226 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  36.61 
 
 
213 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  37.7 
 
 
201 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  37.7 
 
 
225 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  39.23 
 
 
201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  38.54 
 
 
202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0651  Lysophospholipase  35.91 
 
 
214 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.623159  normal  0.969568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  37.57 
 
 
201 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3444  arylesterase  36.27 
 
 
214 aa  125  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000206648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  38.04 
 
 
216 aa  125  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  36.46 
 
 
201 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  37.36 
 
 
226 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  37.36 
 
 
232 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  37.36 
 
 
226 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  37.36 
 
 
226 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  37.36 
 
 
210 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  37.36 
 
 
210 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  36.81 
 
 
232 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23070  Arylesterase protein  37.57 
 
 
198 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.803817  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  37.57 
 
 
205 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  35.44 
 
 
214 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0926755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  37.7 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2242  Arylesterase  37.57 
 
 
200 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0186506  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0010  Arylesterase  34.33 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.939172  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  35.57 
 
 
226 aa  116  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  32.57 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2068  arylesterase  37.57 
 
 
217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  36.32 
 
 
219 aa  115  8.999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  37.08 
 
 
208 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  36.47 
 
 
214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.89 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1815  acyl-CoA thioesterase I precursor  34.91 
 
 
216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  35.33 
 
 
209 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  36.52 
 
 
208 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  34.43 
 
 
195 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  32.65 
 
 
212 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  34.07 
 
 
202 aa  112  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  32.81 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  33.33 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  36.31 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  35.96 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2620  arylesterase  33.33 
 
 
194 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403084  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3020  GDSL family lipase  33.69 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.242695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>