More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0273 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0273  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  100 
 
 
446 aa  914    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000204741  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0119  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.33 
 
 
470 aa  479  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0110  hypothetical protein  51.21 
 
 
476 aa  475  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1860  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.45 
 
 
430 aa  154  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.06 
 
 
447 aa  153  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2766  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.31 
 
 
442 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.412534  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5105  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.66 
 
 
449 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2926  UDP-glucose dehydrogenase, putative  29.62 
 
 
442 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0731315  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  28.42 
 
 
445 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  30.21 
 
 
440 aa  143  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2846  nucleotide sugar dehydrogenase  29.27 
 
 
445 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  30.88 
 
 
440 aa  143  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.45 
 
 
442 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.12 
 
 
445 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  30.27 
 
 
449 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2817  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.72 
 
 
446 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  27.93 
 
 
443 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.37 
 
 
447 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.28 
 
 
447 aa  139  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  28.42 
 
 
445 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.87 
 
 
450 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.55 
 
 
448 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.92 
 
 
442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.38 
 
 
442 aa  137  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.53 
 
 
440 aa  137  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  28.07 
 
 
445 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01224  UDP-glucose dehydrogenase  28.52 
 
 
407 aa  136  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0873171  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  25.96 
 
 
466 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.02 
 
 
446 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  29.47 
 
 
445 aa  133  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3266  putative nucleotide sugar dehydrogenase  26.41 
 
 
453 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.02 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2330  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  29.51 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0299492  normal  0.148756 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2077  nucleotide sugar dehydrogenase  29.51 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1968  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  29.51 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.250179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38360  putative nucleotide sugar dehydrogenase  29.41 
 
 
453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0121251 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  27.24 
 
 
450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.83 
 
 
457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  30.41 
 
 
454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  28.42 
 
 
440 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.03 
 
 
446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323264  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.26 
 
 
439 aa  129  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  27.72 
 
 
445 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.37 
 
 
463 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  28.62 
 
 
448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.77 
 
 
457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2848  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.57 
 
 
459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.29 
 
 
466 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  29.73 
 
 
454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  26.15 
 
 
431 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3190  nucleotide sugar dehydrogenase  26.61 
 
 
453 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.77 
 
 
473 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.89 
 
 
450 aa  126  6e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  27.61 
 
 
522 aa  125  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.39 
 
 
457 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  25.74 
 
 
427 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  27.05 
 
 
450 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  25.35 
 
 
440 aa  125  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  28.78 
 
 
448 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.87 
 
 
458 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.875801  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.08 
 
 
446 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  28.28 
 
 
470 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  27.09 
 
 
482 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2354  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.27 
 
 
453 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241791  hitchhiker  0.0025213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.65 
 
 
453 aa  123  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  26.82 
 
 
441 aa  123  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  29.43 
 
 
473 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.43 
 
 
473 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.67 
 
 
456 aa  123  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  27.08 
 
 
446 aa  123  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0911  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.27 
 
 
449 aa  123  7e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  28.96 
 
 
466 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.77 
 
 
457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4070  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.87 
 
 
449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476098  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.09 
 
 
482 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1104  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.92 
 
 
449 aa  121  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  28.28 
 
 
466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.28 
 
 
466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.27 
 
 
442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3213  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.97 
 
 
503 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.62 
 
 
466 aa  120  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  26.48 
 
 
445 aa  120  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.62 
 
 
466 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.62 
 
 
466 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.92 
 
 
446 aa  119  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  25.61 
 
 
438 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  24.92 
 
 
437 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1843  nucleotide sugar dehydrogenase  27.24 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000229884  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  28.62 
 
 
466 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.94 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2236  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.83 
 
 
452 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  27.53 
 
 
442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  26.83 
 
 
464 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0609  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.7 
 
 
436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000146511  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.86 
 
 
473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  26.64 
 
 
447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.63 
 
 
445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.97 
 
 
467 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  27.42 
 
 
476 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5366  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.22 
 
 
456 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>