More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4701 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  93.32 
 
 		 415 aa  753    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 404 aa  798    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  93.56 
 
 		 404 aa  758    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  94.55 
 
 		 404 aa  762    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  75.93 
 
 		 418 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  75.43 
 
 		 418 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  75.43 
 
 		 429 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  75.68 
 
 		 404 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  74.94 
 
 		 404 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  74.94 
 
 		 429 aa  618  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  70.57 
 
 		 404 aa  563  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  60.1 
 
 		 405 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  60.2 
 
 		 410 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  54.48 
 
 		 408 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  54.7 
 
 		 406 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  54.34 
 
 		 410 aa  458  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  55.14 
 
 		 404 aa  458  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  57.36 
 
 		 405 aa  456  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  56.61 
 
 		 405 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  53.83 
 
 		 438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  56.36 
 
 		 405 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  56.36 
 
 		 411 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  53.1 
 
 		 412 aa  435  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  52.85 
 
 		 404 aa  430  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  51.63 
 
 		 410 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  52.51 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  51.75 
 
 		 398 aa  412  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  47.5 
 
 		 411 aa  324  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  42.71 
 
 		 398 aa  312  6.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  39.85 
 
 		 419 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  42.11 
 
 		 406 aa  266  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  42.11 
 
 		 407 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  40 
 
 		 432 aa  257  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  39.55 
 
 		 414 aa  253  6e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  41.4 
 
 		 429 aa  252  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  39.85 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  39.85 
 
 		 409 aa  246  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  40.46 
 
 		 403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  38.07 
 
 		 409 aa  245  8e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  40.2 
 
 		 406 aa  245  9e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  57.94 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  38.15 
 
 		 410 aa  240  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  55.02 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  36.27 
 
 		 400 aa  233  3e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  39.04 
 
 		 421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  55.02 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  42.95 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  38.86 
 
 		 380 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  37.28 
 
 		 419 aa  222  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  39.49 
 
 		 410 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  48.51 
 
 		 298 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  38.81 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  38.81 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  38.81 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  48.13 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  40.15 
 
 		 419 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  49.02 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  51.47 
 
 		 326 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  48.73 
 
 		 322 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  48.73 
 
 		 322 aa  207  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  48.73 
 
 		 322 aa  207  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  47.77 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  48.73 
 
 		 322 aa  207  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  48.73 
 
 		 322 aa  207  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  48.73 
 
 		 322 aa  207  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  48.73 
 
 		 322 aa  207  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  48.73 
 
 		 322 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  47.81 
 
 		 302 aa  206  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  48.31 
 
 		 322 aa  206  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  52.88 
 
 		 325 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  48.23 
 
 		 325 aa  204  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  38.87 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  38.87 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  52.88 
 
 		 326 aa  203  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  52.88 
 
 		 326 aa  203  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  52.45 
 
 		 322 aa  203  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  52.88 
 
 		 326 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  52.38 
 
 		 281 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  51.44 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  49 
 
 		 279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  51.44 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  51.44 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  51.44 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  51.44 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  47.35 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  47.18 
 
 		 281 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  47.35 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  48.33 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  48.33 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  48.33 
 
 		 281 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  48.32 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  52.91 
 
 		 223 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  46.06 
 
 		 285 aa  196  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  49.27 
 
 		 306 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  48 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  49.28 
 
 		 284 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  47.03 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  45.53 
 
 		 285 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  46.61 
 
 		 279 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  46.86 
 
 		 279 aa  193  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>