68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2822 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  856  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  78.8 
 
 
444 aa  662  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  59.6 
 
 
399 aa  498  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  54.29 
 
 
419 aa  469  1e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  53.73 
 
 
402 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  53.54 
 
 
401 aa  423  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  52.87 
 
 
417 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  33.41 
 
 
399 aa  215  1e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  35.06 
 
 
408 aa  200  4e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  28.57 
 
 
393 aa  191  3e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  31.44 
 
 
394 aa  190  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  30.11 
 
 
396 aa  189  8e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  32.6 
 
 
396 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  31.04 
 
 
431 aa  172  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  30.18 
 
 
383 aa  167  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  26.42 
 
 
433 aa  151  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  28.65 
 
 
407 aa  134  4e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  27.06 
 
 
428 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  27.95 
 
 
392 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  29.27 
 
 
423 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  29.94 
 
 
438 aa  98.6  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  25.28 
 
 
412 aa  96.7  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  29.17 
 
 
400 aa  94  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  29.36 
 
 
422 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  27.17 
 
 
388 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  27.51 
 
 
407 aa  85.9  1e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  26.97 
 
 
418 aa  86.3  1e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  28.94 
 
 
399 aa  84.3  3e-15  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  27.68 
 
 
396 aa  84.7  3e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  27.79 
 
 
414 aa  84  4e-15  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  28.12 
 
 
411 aa  83.6  6e-15  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.82332e-08 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  30.27 
 
 
400 aa  83.2  8e-15  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  27.45 
 
 
396 aa  81.6  2e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  29.11 
 
 
428 aa  81.6  3e-14  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  25.68 
 
 
369 aa  80.5  6e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  25.68 
 
 
412 aa  80.5  6e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  25.68 
 
 
412 aa  80.5  6e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  25.54 
 
 
388 aa  77  5e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  24.01 
 
 
385 aa  71.6  2e-11  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  27.52 
 
 
403 aa  70.9  4e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  26.09 
 
 
407 aa  67  6e-10  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  23.42 
 
 
399 aa  66.6  9e-10  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  25.86 
 
 
416 aa  65.9  1e-09  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  3.64534e-05 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  26.54 
 
 
415 aa  65.5  2e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  26.63 
 
 
487 aa  65.1  2e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  25.5 
 
 
383 aa  63.5  6e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  33.96 
 
 
474 aa  63.2  8e-09  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  24.62 
 
 
382 aa  62.8  1e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  23.61 
 
 
372 aa  60.1  8e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  28.05 
 
 
385 aa  59.7  1e-07  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  27.55 
 
 
443 aa  58.5  2e-07  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  27.53 
 
 
411 aa  55.8  1e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  30.51 
 
 
228 aa  51.2  4e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  23.29 
 
 
358 aa  50.8  4e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3184  methyltransferase small  32.93 
 
 
244 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241453  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  22.75 
 
 
477 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  27.94 
 
 
258 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0978  hypothetical protein  28.1 
 
 
258 aa  46.6  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000585304  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  24.44 
 
 
256 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  22.19 
 
 
375 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  22.55 
 
 
357 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  35.8 
 
 
174 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0800  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  31.71 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  35.9 
 
 
189 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  31.03 
 
 
189 aa  44.7  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1038  methyltransferase  34.21 
 
 
187 aa  43.9  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  32.5 
 
 
174 aa  43.1  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1834  (Uracil-5)-methyltransferase  29.03 
 
 
398 aa  43.1  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>