More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1613 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  100 
 
 		 1052 aa  2187    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  75.12 
 
 		 1053 aa  1688    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  43.34 
 
 		 1314 aa  682    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  73.22 
 
 		 1053 aa  1632    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  77.47 
 
 		 1055 aa  1739    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  63.85 
 
 		 1051 aa  1453    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  42.58 
 
 		 1088 aa  848    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3531  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  43.93 
 
 		 794 aa  643    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.607347  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.83 
 
 		 1125 aa  723    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.64 
 
 		 1053 aa  736    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  74.12 
 
 		 1051 aa  1665    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2162  trehalose 6-phosphate phosphorylase  44.63 
 
 		 807 aa  674    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.40305 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  42.38 
 
 		 807 aa  645    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  66.92 
 
 		 1050 aa  1493    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4794  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  43.56 
 
 		 807 aa  629  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1109  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  40.83 
 
 		 788 aa  611  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.824966  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3044  trehalose 6-phosphate phosphorylase  40.9 
 
 		 804 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.886681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0768  Trehalose 6-phosphate phosphorylase  41.42 
 
 		 904 aa  606  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261171  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3407  HAD family hydrolase  40.15 
 
 		 1215 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.377185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3470  HAD family hydrolase  40.15 
 
 		 1215 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3418  HAD family hydrolase  40.15 
 
 		 1215 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.059768  normal  0.266902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  39.3 
 
 		 1186 aa  597  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4811  trehalose 6-phosphate phosphorylase  43.04 
 
 		 713 aa  594  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  40.72 
 
 		 1327 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  38.67 
 
 		 1225 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0483  trehalose and maltose hydrolase ( phosphorylase)  36.88 
 
 		 769 aa  479  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1283  glycoside hydrolase family protein 65  33 
 
 		 806 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.461041 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  32.51 
 
 		 775 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  32.43 
 
 		 755 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  30.95 
 
 		 780 aa  366  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  31.43 
 
 		 748 aa  366  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  31.84 
 
 		 763 aa  362  3e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  28.89 
 
 		 759 aa  351  5e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  29.92 
 
 		 978 aa  343  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  29.7 
 
 		 780 aa  337  7e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  30.57 
 
 		 965 aa  334  6e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  29.5 
 
 		 778 aa  321  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  29.46 
 
 		 807 aa  313  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  29.25 
 
 		 789 aa  310  8e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  29.24 
 
 		 720 aa  308  5.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  28.63 
 
 		 794 aa  300  7e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  29.15 
 
 		 787 aa  299  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  29.56 
 
 		 781 aa  297  7e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.9 
 
 		 759 aa  295  3e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  29.83 
 
 		 787 aa  293  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  28.94 
 
 		 780 aa  283  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  28.29 
 
 		 769 aa  279  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  34.83 
 
 		 760 aa  279  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  33.58 
 
 		 762 aa  273  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  28.23 
 
 		 781 aa  271  5.9999999999999995e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  33.65 
 
 		 777 aa  271  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  32.26 
 
 		 761 aa  268  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  26.54 
 
 		 774 aa  267  8.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  27.16 
 
 		 790 aa  265  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  32.08 
 
 		 761 aa  265  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.67 
 
 		 313 aa  265  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  28.31 
 
 		 710 aa  260  9e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  26.69 
 
 		 790 aa  259  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  26.13 
 
 		 776 aa  258  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  28.45 
 
 		 748 aa  257  7e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  26.67 
 
 		 767 aa  257  9e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  26.21 
 
 		 771 aa  253  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  24.57 
 
 		 749 aa  253  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  27.23 
 
 		 757 aa  250  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  26.3 
 
 		 805 aa  248  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  27.64 
 
 		 753 aa  247  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  26.47 
 
 		 752 aa  246  9.999999999999999e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  26.39 
 
 		 768 aa  247  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  26.02 
 
 		 755 aa  242  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  26.02 
 
 		 755 aa  242  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  25.76 
 
 		 755 aa  242  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  26.02 
 
 		 755 aa  242  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  25.69 
 
 		 755 aa  242  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  25.29 
 
 		 755 aa  242  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  25.76 
 
 		 755 aa  242  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  26.9 
 
 		 795 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  26.25 
 
 		 755 aa  241  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  24.33 
 
 		 825 aa  240  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.1 
 
 		 250 aa  240  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1155  Kojibiose phosphorylase  26.93 
 
 		 704 aa  238  4e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.162173  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  26.27 
 
 		 858 aa  238  6e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.38 
 
 		 778 aa  236  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  27.08 
 
 		 789 aa  235  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  26.29 
 
 		 795 aa  235  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1019  Kojibiose phosphorylase  26.52 
 
 		 756 aa  235  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  26.11 
 
 		 752 aa  235  3e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.24 
 
 		 525 aa  234  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  25.63 
 
 		 795 aa  233  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  25.32 
 
 		 778 aa  233  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  24.94 
 
 		 834 aa  231  7e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  27.32 
 
 		 788 aa  228  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.41 
 
 		 244 aa  227  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  25.75 
 
 		 765 aa  227  8e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  26.01 
 
 		 780 aa  223  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  46.98 
 
 		 263 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.93 
 
 		 254 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.98 
 
 		 263 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.55 
 
 		 244 aa  219  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.55 
 
 		 263 aa  217  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0524  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.55 
 
 		 251 aa  215  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0185005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>