46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0878 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0694  homospermidine synthase  67.77 
 
 		 486 aa  716    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0878  Homospermidine synthase  100 
 
 		 485 aa  1018    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1047  homospermidine synthase  58.21 
 
 		 480 aa  588  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.129007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2685  homospermidine synthase  53.77 
 
 		 482 aa  538  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137056  normal  0.192597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2622  homospermidine synthase  46.25 
 
 		 481 aa  484  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1354  homospermidine synthase  41.58 
 
 		 475 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2012  Homospermidine synthase  39.3 
 
 		 474 aa  363  5.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50019  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1700  homospermidine synthase  38.59 
 
 		 486 aa  348  9e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.914151  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2562  hypothetical protein  38.72 
 
 		 472 aa  347  2e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3337  homospermidine synthase  37.11 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2416  hypothetical protein  38.51 
 
 		 472 aa  346  6e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1868  homospermidine synthase  39.71 
 
 		 470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4834  homospermidine synthase  39.87 
 
 		 478 aa  336  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1078  homospermidine synthase  38.83 
 
 		 476 aa  335  9e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.417526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0933  Homospermidine synthase  39.38 
 
 		 476 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3423  homospermidine synthase  39.92 
 
 		 477 aa  332  6e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532331  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0921  homospermidine synthase  39.5 
 
 		 478 aa  330  4e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.126033  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1345  homospermidine synthase  40.5 
 
 		 474 aa  329  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0850  homospermidine synthase  38.56 
 
 		 475 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.369039 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4552  homospermidine synthase  38.41 
 
 		 477 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2138  homospermidine synthase  38.76 
 
 		 476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5045  homospermidine synthase  39.38 
 
 		 481 aa  326  6e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2003  Homospermidine synthase  39.83 
 
 		 482 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3707  homospermidine synthase  37.76 
 
 		 480 aa  323  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5462  Homospermidine synthase  39.25 
 
 		 478 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.52008 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1154  Homospermidine synthase  39.09 
 
 		 476 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00185878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2317  Homospermidine synthase  39.21 
 
 		 482 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102013  normal  0.442581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2042  homospermidine synthase  39 
 
 		 482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.418846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3300  Homospermidine synthase  37.5 
 
 		 483 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0451  homospermidine synthase  38 
 
 		 476 aa  319  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1646  homospermidine synthase  38.2 
 
 		 476 aa  317  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322403  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2688  homospermidine synthase  36.67 
 
 		 483 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.621214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3602  Homospermidine synthase  37.08 
 
 		 483 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3061  homospermidine synthase  36.89 
 
 		 469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35790  putative homospermidine synthase  36.89 
 
 		 469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000430191  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2727  homospermidine synthase  37.63 
 
 		 481 aa  313  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4263  homospermidine synthase  35.76 
 
 		 481 aa  303  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393392  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0956  homospermidine synthase  36.14 
 
 		 473 aa  293  6e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2947  homospermidine synthase  38.05 
 
 		 472 aa  291  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0190455 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0078  homospermidine synthase  35.4 
 
 		 481 aa  286  5.999999999999999e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0073  homospermidine synthase  34.38 
 
 		 476 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124838  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  25.97 
 
 		 413 aa  50.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  25.14 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  25.14 
 
 		 413 aa  49.3  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  25.14 
 
 		 426 aa  47  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  24.55 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>