More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1910 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 90 aa  174  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  58.43 
 
 		 91 aa  103  8e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  58.43 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  58.43 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 92 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0170  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 94 aa  100  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000201093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0188  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 94 aa  100  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  59.55 
 
 		 94 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  59.55 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0121  DNA-binding protein HU  53.49 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022412 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  58.43 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2802  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000141643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2488  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000405619  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0658  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79377  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  57.3 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 91 aa  98.6  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  56.18 
 
 		 91 aa  98.6  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0682  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.651291  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  53.93 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1918  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  98.6  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000897645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  97.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  55.06 
 
 		 91 aa  97.8  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  97.8  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2337  histone-like DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000498066  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4704  histone-like DNA-binding protein  55.06 
 
 		 93 aa  96.7  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1341  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 91 aa  95.9  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0010  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4491  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.22 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0852675  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03877  HU, DNA-binding transcriptional regulator, alpha subunit  52.22 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.380115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3994  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  51.69 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4025  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.22 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0158227 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4543  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.22 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.440082  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03830  hypothetical protein  52.22 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.485291  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5469  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.22 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.129609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0500  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759527 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2301  nucleoid protein Hbs  48.89 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.265465  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1538  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000676058  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4234  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.22 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4448  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.22 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.302586  hitchhiker  0.00101008 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0362  histone-like DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  94.7  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  52.81 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  94.4  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4503  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.22 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0164141 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1926  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 92 aa  94.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000201993  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4414  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.22 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.18011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4381  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.22 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.842423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4577  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.22 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511964 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4501  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.22 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.358882  normal  0.0495174 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  55.06 
 
 		 91 aa  94.4  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 91 aa  94.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0213  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.22 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00855152  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3864  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.22 
 
 		 90 aa  93.6  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78216  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3710  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.22 
 
 		 90 aa  93.6  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  50.56 
 
 		 91 aa  93.6  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0219  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 96 aa  93.2  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.132966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 91 aa  93.6  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2014  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000105311  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1364  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>