More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0682 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0682  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 90 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.651291  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0658  histone family protein DNA-binding protein  96.67 
 
 		 90 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79377  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0010  histone family protein DNA-binding protein  64.04 
 
 		 91 aa  112  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649518  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0429  histone family protein DNA-binding protein  63.33 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00929572  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 91 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  58.43 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  59.55 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  58.89 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 92 aa  103  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  60.67 
 
 		 91 aa  103  8e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  59.77 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  57.3 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  57.3 
 
 		 91 aa  98.6  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2800  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  98.6  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.314241 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0431  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00947903  hitchhiker  0.00103246 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0983  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 98 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0475372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0956  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 98 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  51.11 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  53.33 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2489  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0648  non-specific DNA-binding protein HBsu  55.29 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.271458  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0180  histone family protein DNA-binding protein  58.14 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000456063  normal  0.670354 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  94.4  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  51.11 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 92 aa  93.6  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 91 aa  93.6  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  50 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  50 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  50 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4008  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2802  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000141643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2488  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000405619  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  52.87 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  51.11 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  55.06 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2301  nucleoid protein Hbs  47.78 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.265465  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0673  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 92 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  51.69 
 
 		 94 aa  90.9  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 94 aa  90.9  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  46.67 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  51.11 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2053  nucleoid protein HU beta subunit  51.11 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000457213  normal  0.0670315 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  50 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  50 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  48.89 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  48.89 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  50 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  48.89 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>