211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1632 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  100 
 
 
169 aa  353  6.999999999999999e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  67.07 
 
 
169 aa  238  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  67.47 
 
 
167 aa  236  9e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  67.66 
 
 
170 aa  234  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  67.66 
 
 
170 aa  234  3e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  64.07 
 
 
170 aa  223  7e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  54.82 
 
 
167 aa  202  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  56.89 
 
 
168 aa  195  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  47.25 
 
 
184 aa  176  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  49.73 
 
 
185 aa  174  7e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  48.35 
 
 
184 aa  174  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  45.56 
 
 
182 aa  170  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  45.9 
 
 
185 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  46.7 
 
 
184 aa  169  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  46.67 
 
 
182 aa  168  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  44.44 
 
 
165 aa  147  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  44.44 
 
 
165 aa  147  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  45.4 
 
 
166 aa  147  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  44.79 
 
 
166 aa  143  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  38.46 
 
 
182 aa  143  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  43.48 
 
 
166 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  45.62 
 
 
166 aa  142  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  42.86 
 
 
166 aa  141  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  43.29 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  43.98 
 
 
168 aa  137  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  43.79 
 
 
168 aa  136  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  42.68 
 
 
165 aa  136  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  43.21 
 
 
164 aa  134  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  46.79 
 
 
168 aa  134  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  42.59 
 
 
173 aa  134  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  44.38 
 
 
165 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  41.46 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  40.37 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  41.25 
 
 
164 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  38.65 
 
 
166 aa  130  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  41.67 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  40.24 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  41.03 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  41.67 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  41.72 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  41.03 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  40.62 
 
 
166 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  39.13 
 
 
166 aa  127  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  41.72 
 
 
167 aa  127  9.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  41.61 
 
 
172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  40.62 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  41.42 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  40.48 
 
 
164 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  43.21 
 
 
164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  40 
 
 
166 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  38.75 
 
 
163 aa  124  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  39.88 
 
 
166 aa  123  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  42.86 
 
 
165 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  40.26 
 
 
166 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  45.06 
 
 
164 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  38.12 
 
 
168 aa  122  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  45.62 
 
 
163 aa  121  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  37.5 
 
 
166 aa  117  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  37.5 
 
 
166 aa  112  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  39.51 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  35.26 
 
 
184 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  43.75 
 
 
169 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  33.9 
 
 
202 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  35.03 
 
 
228 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  33.33 
 
 
202 aa  89  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  31.64 
 
 
202 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  32.2 
 
 
263 aa  84.3  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  34.09 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  33.94 
 
 
167 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  34.97 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  32.73 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  32.73 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  33.94 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  32.32 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  34.15 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  30.85 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  36.14 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  32.57 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  34.15 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  32.57 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0398  Rubrerythrin  32.2 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  32.57 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  32.54 
 
 
392 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  32.58 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  30.22 
 
 
191 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  31.69 
 
 
191 aa  73.9  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  32.35 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  34.68 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  29.45 
 
 
233 aa  72  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  32.07 
 
 
192 aa  72  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  30.22 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  29.89 
 
 
215 aa  70.9  0.000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  32.37 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  29.49 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2617  Rubrerythrin  34.62 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  33.33 
 
 
696 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  30.3 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  32.08 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  29.67 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  31.98 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>