53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1345 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  100 
 
 
456 aa  912    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  56 
 
 
456 aa  521  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  56.98 
 
 
456 aa  511  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  35.06 
 
 
462 aa  242  7.999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  33.63 
 
 
478 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  32.84 
 
 
463 aa  180  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  29.71 
 
 
463 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  30.68 
 
 
473 aa  176  8e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  28.85 
 
 
464 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  31.34 
 
 
461 aa  171  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  28.67 
 
 
460 aa  168  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  29.18 
 
 
450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  27.72 
 
 
471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  31.1 
 
 
454 aa  164  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  28.29 
 
 
464 aa  161  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  26.25 
 
 
460 aa  160  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  28.22 
 
 
496 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  28.54 
 
 
462 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  26 
 
 
474 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  30.97 
 
 
457 aa  152  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  30.13 
 
 
431 aa  150  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  27 
 
 
458 aa  150  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  27.39 
 
 
407 aa  147  5e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  25.91 
 
 
463 aa  146  9e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  28.05 
 
 
464 aa  140  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  28.34 
 
 
476 aa  141  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  25.7 
 
 
457 aa  136  8e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  25.16 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  28.12 
 
 
456 aa  134  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  32.01 
 
 
439 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  25.43 
 
 
470 aa  133  7.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  29.13 
 
 
454 aa  133  7.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  33.41 
 
 
420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  28.57 
 
 
443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  26.58 
 
 
463 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  23.71 
 
 
469 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  30.03 
 
 
439 aa  113  6e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  25.43 
 
 
487 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  22.2 
 
 
472 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  21.07 
 
 
470 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  22.09 
 
 
498 aa  70.9  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  22.13 
 
 
474 aa  69.3  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  20.67 
 
 
475 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  24.05 
 
 
485 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  21.28 
 
 
472 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2379  ATPase  26.98 
 
 
356 aa  60.5  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  19.09 
 
 
509 aa  57.4  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0384  ATPase  21.04 
 
 
361 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000176931  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  23.15 
 
 
383 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  18.55 
 
 
480 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  28 
 
 
304 aa  44.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0594  conserved hypothetical protein (DUF234 domain protein)  25.94 
 
 
283 aa  45.1  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000231419  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1219  hypothetical protein  26.24 
 
 
273 aa  43.5  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>