122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2618 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2618  metal-dependent hydrolase-like protein  100 
 
 		 278 aa  586  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00276728  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44510  hypothetical protein  74.82 
 
 		 278 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.319734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3790  hypothetical protein  74.46 
 
 		 278 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2960  hypothetical protein  44.79 
 
 		 291 aa  228  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0165  hypothetical protein  44.7 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4070  metal-dependent hydrolase  44.27 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.954367  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3692  metal-dependent hydrolase  43.13 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4676  metal-dependent hydrolase  43.13 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5624  metal-dependent hydrolase  43.3 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4017  metal-dependent hydrolase  42.59 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279425  normal  0.558393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3653  metal-dependent hydrolase-like protein  41.26 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3654  metal-dependent hydrolase-like protein  41.11 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4528  metal-dependent hydrolase  42.91 
 
 		 301 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1143  metal-dependent hydrolase  42.42 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316817  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1473  hypothetical protein  42.8 
 
 		 304 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2523  hypothetical protein  41.67 
 
 		 304 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0560  hypothetical protein  41.67 
 
 		 304 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259074  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1345  hypothetical protein  41.67 
 
 		 304 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1007  metal-dependent hydrolase  41.67 
 
 		 304 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53530  hypothetical protein  39.85 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4691  hypothetical protein  39.85 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1930  metal-dependent hydrolase-like protein  38.35 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242298 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1268  hypothetical protein  41.29 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0169  hypothetical protein  39.77 
 
 		 296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1341  hypothetical protein  39.77 
 
 		 296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2739  hypothetical protein  39.77 
 
 		 296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.910549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2596  hypothetical protein  39.77 
 
 		 296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0196  hypothetical protein  39.77 
 
 		 296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1791  hypothetical protein  40.75 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000624384 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1012  hypothetical protein  40.5 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0463  hypothetical protein  39 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4877  membrane protein  40.38 
 
 		 293 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000561399  normal  0.621694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3737  metal-dependent hydrolase-like protein  39.26 
 
 		 307 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5561  metal-dependent hydrolase-like protein  40.07 
 
 		 307 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2259  metal-dependent hydrolase-like  38.89 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0372522  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4526  metal-dependent hydrolase-like  38.89 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3837  metal-dependent hydrolase-like protein  38.89 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0372117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3688  metal-dependent hydrolase-like protein  38.89 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2091  metal-dependent hydrolase  38.43 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4904  metal-dependent hydrolase-like protein  38.22 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  hitchhiker  0.000304166 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0906  hypothetical protein  37.45 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2610  hypothetical protein  37.45 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2472  hypothetical protein  37.45 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0083  metal-dependent hydrolase-like protein  37.3 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0555  hypothetical protein  37.18 
 
 		 302 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0628824  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4513  metal-dependent hydrolase  38.11 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3015  FF domain protein  39.42 
 
 		 298 aa  161  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3601  FF domain-containing protein  41.08 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4103  FF domain-containing protein  36.43 
 
 		 285 aa  158  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.852892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3362  FF domain protein  39.74 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4593  metal-dependent hydrolase  35.25 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0314  metal-dependent hydrolase  34.55 
 
 		 289 aa  148  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0738  metal-dependent hydrolase  33.21 
 
 		 297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0667904 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4629  metal-dependent hydrolase  34.67 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2446  hypothetical protein  34.48 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1177  hypothetical protein  34.48 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3199  metal-dependent hydrolase  32.96 
 
 		 289 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3261  metal-dependent hydrolase  32.96 
 
 		 289 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3208  metal-dependent hydrolase  32.96 
 
 		 289 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1556  hypothetical protein  35.23 
 
 		 294 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2822  hypothetical protein  35.98 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000149451  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0723  hypothetical protein  34.1 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0738  hypothetical protein  34.1 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1250  metal-dependent hydrolase  34.1 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1703  hypothetical protein  34.1 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0453  hypothetical protein  34.7 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0464  hypothetical protein  34.7 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.416793  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0440  hypothetical protein  34.7 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2084  FF domain-containing protein  37.14 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0932  FF domain-containing protein  33.33 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438166  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2354  hypothetical protein  33.58 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19546  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3135  hypothetical protein  33.58 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12790  hypothetical protein  29.46 
 
 		 356 aa  125  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.89049  normal  0.675408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8730  hypothetical protein  28.68 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4392  metal-dependent hydrolase  31.75 
 
 		 301 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4911  metal-dependent hydrolase  30.38 
 
 		 301 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1350  FF domain-containing protein  34.15 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.0894985 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1809  FF domain-containing protein  32.12 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1795  hypothetical protein  30.11 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3648  metal-dependent hydrolase  31.66 
 
 		 301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2251  putative metal-dependent hydrolase  29.08 
 
 		 311 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000117397  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5316  metal-dependent hydrolase  30.89 
 
 		 301 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.14239 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1193  FF domain-containing protein  30.48 
 
 		 440 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0958504  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3397  metal-dependent hydrolase  30.89 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4970  metal-dependent hydrolase  30.89 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0221  hypothetical protein  29.85 
 
 		 434 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0912  hypothetical protein  30.18 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0391882  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2173  hypothetical protein  30.18 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425702  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0819  hypothetical protein  30.18 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1062  hypothetical protein  29.85 
 
 		 300 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0052  hypothetical protein  29.85 
 
 		 300 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0366  hypothetical protein  29.85 
 
 		 300 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1219  hypothetical protein  29.85 
 
 		 300 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0708  metal-dependent hydrolase  30.5 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21040  hypothetical protein  29 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1638  hypothetical protein  29.48 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1296  FF domain protein  29.35 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0684567  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1727  hypothetical protein  29.1 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1360  metal-dependent hydrolase  28.26 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3179  hypothetical protein  28.9 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.17273  normal  0.100339 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>