More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2885 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2885  acyltransferase 3  100 
 
 
385 aa  758    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  30.05 
 
 
367 aa  147  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  32.2 
 
 
362 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  33.33 
 
 
435 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  31.48 
 
 
383 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  32.81 
 
 
383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  32.28 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3407  acyltransferase 3  33.43 
 
 
383 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2754  acyltransferase 3  36.51 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  31.42 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4250  acyltransferase 3  32.84 
 
 
383 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330616  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4116  acyltransferase 3  32.84 
 
 
383 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  31.79 
 
 
405 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  28.61 
 
 
386 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  31.19 
 
 
695 aa  104  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  29.78 
 
 
346 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  29.82 
 
 
378 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  43.59 
 
 
374 aa  103  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  29.97 
 
 
380 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  27.85 
 
 
603 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  27.85 
 
 
603 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  38.76 
 
 
377 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  31.33 
 
 
372 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  27.69 
 
 
379 aa  99.8  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  29.97 
 
 
604 aa  99.4  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  29.97 
 
 
604 aa  99.4  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  30.63 
 
 
360 aa  95.9  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  30.79 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  24.94 
 
 
366 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  41.51 
 
 
357 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  31.15 
 
 
339 aa  93.6  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  28.72 
 
 
690 aa  92.8  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28.3 
 
 
656 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  30.28 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1161  acyltransferase 3  28.97 
 
 
365 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  31.66 
 
 
690 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2326  acyltransferase 3  34.72 
 
 
402 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  30.95 
 
 
675 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1531  acyltransferase 3  34.72 
 
 
382 aa  90.5  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5497  acyltransferase 3  39.39 
 
 
977 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.114019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  27.32 
 
 
583 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  32.53 
 
 
675 aa  90.1  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0901  acyltransferase 3  34.02 
 
 
382 aa  89.7  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.883009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  29.52 
 
 
695 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  29.97 
 
 
638 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  26.87 
 
 
602 aa  89  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  27.01 
 
 
640 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  29.3 
 
 
660 aa  89  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  30.33 
 
 
377 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  33.44 
 
 
372 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  29.05 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  28.54 
 
 
671 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  34.95 
 
 
634 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  33.44 
 
 
368 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  36 
 
 
604 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  31.37 
 
 
671 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  37.35 
 
 
607 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5887  acyltransferase 3  35.8 
 
 
406 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0355428  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0723  acyltransferase 3  32.32 
 
 
632 aa  87.4  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  29.74 
 
 
641 aa  87  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4586  acyltransferase 3  39.73 
 
 
385 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0254963  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  30.63 
 
 
667 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  27.3 
 
 
671 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  28.95 
 
 
637 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  30.14 
 
 
684 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  39.22 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  38.51 
 
 
621 aa  85.5  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  37.57 
 
 
673 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  30.12 
 
 
665 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  40.37 
 
 
656 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  30.09 
 
 
690 aa  83.6  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.42 
 
 
616 aa  83.2  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1143  acyltransferase 3  29.82 
 
 
388 aa  82.8  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  26.76 
 
 
660 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  36.67 
 
 
711 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2002  acyltransferase 3  35.67 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  28.73 
 
 
629 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  27.17 
 
 
603 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  27.56 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  32.15 
 
 
630 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  28.88 
 
 
683 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  28.14 
 
 
713 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  28.27 
 
 
660 aa  80.1  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1071  acyltransferase 3  31.71 
 
 
366 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.710446 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5005  acyltransferase family protein  26.7 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0174  acyltransferase-like  29.89 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  29.68 
 
 
651 aa  79.7  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0757  acyltransferase family protein  41.11 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2294  putative acyltransferase  41.11 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2881  acyltransferase 3  29.8 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  34.09 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1457  acyltransferase 3  40.23 
 
 
645 aa  79.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  37.5 
 
 
645 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  29.47 
 
 
690 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  30.82 
 
 
716 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  26.38 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  32.31 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1708  acyltransferase family protein  40.78 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110061  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  31.97 
 
 
682 aa  78.2  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1869  acyltransferase family protein  40.78 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>