42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1905 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  848    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  35.04 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  30.73 
 
 		 420 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  27.35 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4538  hypothetical protein  29.65 
 
 		 540 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  29.44 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6052  hypothetical protein  30.2 
 
 		 546 aa  154  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157473  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3412  hypothetical protein  30.83 
 
 		 566 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295964  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4284  conserved hypothetical proteinn  30.4 
 
 		 597 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0865  hypothetical protein  30.69 
 
 		 564 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  29.43 
 
 		 571 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3898  hypothetical protein  30.85 
 
 		 647 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3606  hypothetical protein  30.85 
 
 		 646 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  28.57 
 
 		 563 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  28.61 
 
 		 537 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1361  hypothetical protein  30.05 
 
 		 568 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515582  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7239  hypothetical protein  29.48 
 
 		 528 aa  143  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  31.17 
 
 		 592 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0932  hypothetical protein  28.03 
 
 		 563 aa  126  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0523701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  27.75 
 
 		 617 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3308  hypothetical protein  26.94 
 
 		 511 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2706  hypothetical protein  27.56 
 
 		 467 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  26.15 
 
 		 590 aa  99.8  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2738  hypothetical protein  24.42 
 
 		 515 aa  98.2  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.22803  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4270  hypothetical protein  24.68 
 
 		 528 aa  94  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0072  hypothetical protein  26.18 
 
 		 512 aa  92.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387574  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0067  hypothetical protein  26.18 
 
 		 502 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3610  hypothetical protein  26.11 
 
 		 513 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3723  hypothetical protein  26.46 
 
 		 505 aa  87.8  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0735  hypothetical protein  24.73 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0886223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0809  hypothetical protein  23.44 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1071  hypothetical protein  23.1 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  21.45 
 
 		 552 aa  80.5  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02479  hypothetical protein  26.01 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.919961  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1383  hypothetical protein  23.16 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0585585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2813  hypothetical protein  22.61 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1659  hypothetical protein  21.81 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000022104  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0459  hypothetical protein  22.33 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0790  hypothetical protein  23.64 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.843096  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001325  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsB  24.07 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.138283  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05206  hypothetical protein  23.2 
 
 		 408 aa  50.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1174  hypothetical protein  24.49 
 
 		 477 aa  47.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.605378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>