33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3606 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3606  hypothetical protein  100 
 
 		 646 aa  1261    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3898  hypothetical protein  98.92 
 
 		 647 aa  1152    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4284  conserved hypothetical proteinn  84.39 
 
 		 597 aa  940    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  55.69 
 
 		 592 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7239  hypothetical protein  50 
 
 		 528 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6052  hypothetical protein  46.57 
 
 		 546 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157473  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  35.78 
 
 		 571 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  35.59 
 
 		 563 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0865  hypothetical protein  35.38 
 
 		 564 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4538  hypothetical protein  35.14 
 
 		 540 aa  224  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3412  hypothetical protein  34.38 
 
 		 566 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1361  hypothetical protein  33.76 
 
 		 568 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515582  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0932  hypothetical protein  33.41 
 
 		 563 aa  208  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0523701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  31.51 
 
 		 617 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  30.89 
 
 		 552 aa  171  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  31.12 
 
 		 590 aa  161  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4270  hypothetical protein  30.21 
 
 		 528 aa  158  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3308  hypothetical protein  31.67 
 
 		 511 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  30.85 
 
 		 423 aa  148  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3610  hypothetical protein  31.25 
 
 		 513 aa  143  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2738  hypothetical protein  30.42 
 
 		 515 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.22803  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0067  hypothetical protein  27.68 
 
 		 502 aa  139  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0072  hypothetical protein  27.68 
 
 		 512 aa  139  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387574  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2706  hypothetical protein  28.11 
 
 		 467 aa  127  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  26.23 
 
 		 451 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3723  hypothetical protein  29.57 
 
 		 505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  25.57 
 
 		 420 aa  107  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  27.62 
 
 		 424 aa  104  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  25.57 
 
 		 537 aa  97.8  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0735  hypothetical protein  26.18 
 
 		 437 aa  62  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0886223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  23.21 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0809  hypothetical protein  21 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0790  hypothetical protein  24.06 
 
 		 441 aa  46.2  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.843096  normal  0.984184 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>