20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0809 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0809  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  810    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  25.58 
 
 
400 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  23.44 
 
 
423 aa  84  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  22.58 
 
 
537 aa  82  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  24.03 
 
 
424 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1071  hypothetical protein  21.66 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3898  hypothetical protein  21.52 
 
 
647 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242852  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4284  conserved hypothetical proteinn  21.5 
 
 
597 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3606  hypothetical protein  21.52 
 
 
646 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  21.01 
 
 
592 aa  57  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001325  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsB  21.59 
 
 
401 aa  57  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.138283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02479  hypothetical protein  21.2 
 
 
391 aa  53.5  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.919961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2813  hypothetical protein  20.67 
 
 
386 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1383  hypothetical protein  20.16 
 
 
403 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0585585  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05206  hypothetical protein  21.69 
 
 
408 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1659  hypothetical protein  24.7 
 
 
419 aa  50.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000022104  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7239  hypothetical protein  22 
 
 
528 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6052  hypothetical protein  20.21 
 
 
546 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157473  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  17.36 
 
 
420 aa  46.6  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0459  hypothetical protein  20.22 
 
 
398 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>