18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1383 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1383  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  820    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0585585  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02479  hypothetical protein  34.52 
 
 		 391 aa  208  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.919961  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1071  hypothetical protein  33.16 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0459  hypothetical protein  31.93 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05206  hypothetical protein  26.35 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001325  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsB  25.43 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.138283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1174  hypothetical protein  27.52 
 
 		 477 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.605378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2813  hypothetical protein  24.3 
 
 		 386 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3173  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0459  hypothetical protein  23.48 
 
 		 438 aa  90.5  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111213  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3559  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 428 aa  89.7  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0585  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  23.16 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  22.54 
 
 		 420 aa  53.1  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0809  hypothetical protein  20.16 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1659  hypothetical protein  20.11 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000022104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1537  hypothetical protein  24.59 
 
 		 448 aa  50.8  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  20.41 
 
 		 424 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>