38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4529 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  847    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  30.73 
 
 		 423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  27.83 
 
 		 424 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  28.11 
 
 		 571 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  25.82 
 
 		 537 aa  117  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  26.95 
 
 		 563 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4538  hypothetical protein  27.81 
 
 		 540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0865  hypothetical protein  29.89 
 
 		 564 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7239  hypothetical protein  27.95 
 
 		 528 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3412  hypothetical protein  27.84 
 
 		 566 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295964  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  24.3 
 
 		 451 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3898  hypothetical protein  25.57 
 
 		 647 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3606  hypothetical protein  25.57 
 
 		 646 aa  107  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6052  hypothetical protein  26.29 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157473  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  26.48 
 
 		 592 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1361  hypothetical protein  25.12 
 
 		 568 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515582  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4284  conserved hypothetical proteinn  24.75 
 
 		 597 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0932  hypothetical protein  27.63 
 
 		 563 aa  99  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0523701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2738  hypothetical protein  26.7 
 
 		 515 aa  94.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.22803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  23.32 
 
 		 617 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  22.92 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  25.31 
 
 		 590 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4270  hypothetical protein  23.74 
 
 		 528 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0072  hypothetical protein  24.75 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387574  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0067  hypothetical protein  24.75 
 
 		 502 aa  75.1  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3723  hypothetical protein  22.1 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  23.32 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3308  hypothetical protein  21.3 
 
 		 511 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2706  hypothetical protein  20.89 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3610  hypothetical protein  21.54 
 
 		 513 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2813  hypothetical protein  20.81 
 
 		 386 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1659  hypothetical protein  20.79 
 
 		 419 aa  53.5  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000022104  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1383  hypothetical protein  22.54 
 
 		 403 aa  53.1  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0585585  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0735  hypothetical protein  23.26 
 
 		 437 aa  47.4  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0886223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02479  hypothetical protein  21.68 
 
 		 391 aa  47  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.919961  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0809  hypothetical protein  17.36 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0790  hypothetical protein  20.19 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.843096  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001325  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsB  23.49 
 
 		 401 aa  43.1  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.138283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>