27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001325 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001325  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsB  100 
 
 		 401 aa  829    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.138283  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05206  hypothetical protein  74.31 
 
 		 408 aa  650    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0459  hypothetical protein  30.1 
 
 		 398 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1071  hypothetical protein  29.82 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1383  hypothetical protein  25.43 
 
 		 403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0585585  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02479  hypothetical protein  26.47 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.919961  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1174  hypothetical protein  28.12 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.605378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2813  hypothetical protein  24.6 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0585  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 428 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3173  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 		 428 aa  87  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0459  hypothetical protein  24.65 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111213  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3559  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  23.99 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  22.12 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0809  hypothetical protein  22.22 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  23.81 
 
 		 617 aa  56.6  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1659  hypothetical protein  21.25 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000022104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  24.07 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  27.21 
 
 		 590 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  25.34 
 
 		 552 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  24.34 
 
 		 451 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  22.56 
 
 		 563 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3412  hypothetical protein  22.56 
 
 		 566 aa  47  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295964  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1876  hypothetical protein  21.33 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.653698  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1537  hypothetical protein  23.05 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  23.49 
 
 		 420 aa  43.1  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  29.33 
 
 		 592 aa  43.1  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>