34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6670 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  100 
 
 		 590 aa  1186    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  46.05 
 
 		 617 aa  333  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  41.24 
 
 		 552 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  36.3 
 
 		 563 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0865  hypothetical protein  35.64 
 
 		 564 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3412  hypothetical protein  33.92 
 
 		 566 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295964  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  34.09 
 
 		 571 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4538  hypothetical protein  33.85 
 
 		 540 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1361  hypothetical protein  34.03 
 
 		 568 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515582  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0932  hypothetical protein  32.91 
 
 		 563 aa  206  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0523701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7239  hypothetical protein  32.41 
 
 		 528 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6052  hypothetical protein  30.55 
 
 		 546 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157473  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4284  conserved hypothetical proteinn  32.04 
 
 		 597 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3898  hypothetical protein  31.12 
 
 		 647 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3606  hypothetical protein  31.12 
 
 		 646 aa  161  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  28.53 
 
 		 592 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4270  hypothetical protein  27.11 
 
 		 528 aa  134  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0067  hypothetical protein  25.39 
 
 		 502 aa  127  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0072  hypothetical protein  25.39 
 
 		 512 aa  127  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387574  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3610  hypothetical protein  28.14 
 
 		 513 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3308  hypothetical protein  27 
 
 		 511 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2738  hypothetical protein  24.2 
 
 		 515 aa  109  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.22803  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  26.15 
 
 		 423 aa  100  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  26.51 
 
 		 424 aa  97.4  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2706  hypothetical protein  24.45 
 
 		 467 aa  93.6  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3723  hypothetical protein  25.63 
 
 		 505 aa  89.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  24.24 
 
 		 537 aa  79.3  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  25.22 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  25.31 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  22.02 
 
 		 400 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05206  hypothetical protein  25.17 
 
 		 408 aa  55.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001325  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsB  27.21 
 
 		 401 aa  54.3  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.138283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1071  hypothetical protein  29.63 
 
 		 380 aa  49.3  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1659  hypothetical protein  23.05 
 
 		 419 aa  43.5  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000022104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>