32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3610 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3610  hypothetical protein  100 
 
 
513 aa  1031    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3308  hypothetical protein  91.67 
 
 
511 aa  939    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2706  hypothetical protein  48.98 
 
 
467 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3723  hypothetical protein  47.26 
 
 
505 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4270  hypothetical protein  34.12 
 
 
528 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2738  hypothetical protein  39.49 
 
 
515 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.22803  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0067  hypothetical protein  32.33 
 
 
502 aa  221  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0072  hypothetical protein  31.98 
 
 
512 aa  221  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387574  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4284  conserved hypothetical proteinn  31.04 
 
 
597 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3606  hypothetical protein  31.25 
 
 
646 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3898  hypothetical protein  31.25 
 
 
647 aa  150  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242852  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7239  hypothetical protein  28.61 
 
 
528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6052  hypothetical protein  26.85 
 
 
546 aa  131  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157473  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  27.12 
 
 
592 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  26.93 
 
 
590 aa  110  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  28.65 
 
 
571 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  26.18 
 
 
617 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0865  hypothetical protein  25.26 
 
 
564 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  27.33 
 
 
563 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3412  hypothetical protein  26.15 
 
 
566 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295964  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  26.11 
 
 
423 aa  100  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1361  hypothetical protein  25.65 
 
 
568 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515582  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4538  hypothetical protein  25.38 
 
 
540 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0932  hypothetical protein  24.01 
 
 
563 aa  92.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0523701  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  22.64 
 
 
552 aa  87.4  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  25.07 
 
 
451 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  28.49 
 
 
424 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  25.65 
 
 
400 aa  73.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  21.54 
 
 
420 aa  65.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  24.92 
 
 
537 aa  64.3  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0735  hypothetical protein  27.04 
 
 
437 aa  49.7  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0886223  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0809  hypothetical protein  19.35 
 
 
394 aa  47.8  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>