35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1306 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  100 
 
 		 617 aa  1237    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  45.99 
 
 		 590 aa  333  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  41.24 
 
 		 552 aa  323  8e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  39 
 
 		 563 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0865  hypothetical protein  36.39 
 
 		 564 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3412  hypothetical protein  35.95 
 
 		 566 aa  273  6e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1361  hypothetical protein  35.23 
 
 		 568 aa  273  9e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515582  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  34.27 
 
 		 571 aa  260  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4538  hypothetical protein  33.66 
 
 		 540 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0932  hypothetical protein  33.76 
 
 		 563 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0523701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7239  hypothetical protein  33.25 
 
 		 528 aa  217  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6052  hypothetical protein  30.59 
 
 		 546 aa  204  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157473  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  32.61 
 
 		 592 aa  197  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3606  hypothetical protein  31.2 
 
 		 646 aa  191  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4284  conserved hypothetical proteinn  31.43 
 
 		 597 aa  191  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3898  hypothetical protein  31.2 
 
 		 647 aa  191  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4270  hypothetical protein  26.53 
 
 		 528 aa  136  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2738  hypothetical protein  24.74 
 
 		 515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.22803  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  26.03 
 
 		 537 aa  127  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0072  hypothetical protein  25.33 
 
 		 512 aa  125  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387574  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0067  hypothetical protein  25.33 
 
 		 502 aa  124  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  27.75 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  25.27 
 
 		 451 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3308  hypothetical protein  25.69 
 
 		 511 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2706  hypothetical protein  23.39 
 
 		 467 aa  104  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3610  hypothetical protein  29.07 
 
 		 513 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3723  hypothetical protein  27.05 
 
 		 505 aa  98.2  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  23.32 
 
 		 420 aa  89  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  25.21 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  23.78 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05206  hypothetical protein  23.78 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001325  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsB  23.81 
 
 		 401 aa  56.2  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.138283  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2813  hypothetical protein  23.78 
 
 		 386 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1659  hypothetical protein  22.73 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000022104  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1595  hypothetical protein  23.15 
 
 		 383 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>