39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1489 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  913    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  27.35 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  27.59 
 
 		 424 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4284  conserved hypothetical proteinn  28.03 
 
 		 597 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3898  hypothetical protein  26.23 
 
 		 647 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3606  hypothetical protein  26.23 
 
 		 646 aa  117  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  26.27 
 
 		 537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  24.35 
 
 		 552 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  24.5 
 
 		 617 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  24.3 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  24.34 
 
 		 592 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  23.78 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1361  hypothetical protein  26.82 
 
 		 568 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515582  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0865  hypothetical protein  25.45 
 
 		 564 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4538  hypothetical protein  27.27 
 
 		 540 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2738  hypothetical protein  26.33 
 
 		 515 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.22803  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3412  hypothetical protein  25.91 
 
 		 566 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295964  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2706  hypothetical protein  26 
 
 		 467 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6052  hypothetical protein  23.39 
 
 		 546 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157473  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7239  hypothetical protein  23.99 
 
 		 528 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  24.49 
 
 		 571 aa  90.1  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4270  hypothetical protein  24.77 
 
 		 528 aa  87.4  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0932  hypothetical protein  22.48 
 
 		 563 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0523701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  23.48 
 
 		 563 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0790  hypothetical protein  26.37 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.843096  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3723  hypothetical protein  24.5 
 
 		 505 aa  79.7  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  25.21 
 
 		 590 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0072  hypothetical protein  25 
 
 		 512 aa  77  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387574  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0067  hypothetical protein  25.32 
 
 		 502 aa  76.6  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3308  hypothetical protein  24.52 
 
 		 511 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0735  hypothetical protein  31.91 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0886223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3610  hypothetical protein  24.73 
 
 		 513 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1537  hypothetical protein  24.57 
 
 		 448 aa  54.3  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1071  hypothetical protein  20.47 
 
 		 380 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001325  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsB  24.34 
 
 		 401 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.138283  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2813  hypothetical protein  20.16 
 
 		 386 aa  43.9  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1445  hypothetical protein  30.88 
 
 		 410 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05206  hypothetical protein  19.5 
 
 		 408 aa  43.5  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0459  hypothetical protein  21.83 
 
 		 398 aa  43.1  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>