43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4817 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  863    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  35.04 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  27.83 
 
 
420 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  27.59 
 
 
451 aa  138  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7239  hypothetical protein  27.59 
 
 
528 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  26.11 
 
 
400 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  27.83 
 
 
571 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  27 
 
 
592 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  25.71 
 
 
537 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6052  hypothetical protein  25.83 
 
 
546 aa  110  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157473  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4538  hypothetical protein  27.41 
 
 
540 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  24.33 
 
 
563 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0865  hypothetical protein  26.08 
 
 
564 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3898  hypothetical protein  27.62 
 
 
647 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242852  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3606  hypothetical protein  27.62 
 
 
646 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1361  hypothetical protein  27.22 
 
 
568 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515582  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4284  conserved hypothetical proteinn  26.67 
 
 
597 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0735  hypothetical protein  24.47 
 
 
437 aa  99.8  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0886223  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2738  hypothetical protein  26.38 
 
 
515 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.22803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  22.4 
 
 
552 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3412  hypothetical protein  25 
 
 
566 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  26.51 
 
 
590 aa  97.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0932  hypothetical protein  23.44 
 
 
563 aa  87.4  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0523701  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  23.78 
 
 
617 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4270  hypothetical protein  23.46 
 
 
528 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3610  hypothetical protein  28.01 
 
 
513 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0809  hypothetical protein  23.87 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0072  hypothetical protein  26.11 
 
 
512 aa  73.6  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387574  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0067  hypothetical protein  26.11 
 
 
502 aa  73.6  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0790  hypothetical protein  23.51 
 
 
441 aa  72.8  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.843096  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3308  hypothetical protein  27.11 
 
 
511 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3723  hypothetical protein  24.79 
 
 
505 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2706  hypothetical protein  26.01 
 
 
467 aa  66.6  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001325  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsB  22.12 
 
 
401 aa  60.5  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.138283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02479  hypothetical protein  25.69 
 
 
391 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.919961  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0459  hypothetical protein  25.51 
 
 
398 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1071  hypothetical protein  23.59 
 
 
380 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05206  hypothetical protein  22.28 
 
 
408 aa  53.9  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0585  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3559  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 
428 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1383  hypothetical protein  20.41 
 
 
403 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0585585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2813  hypothetical protein  21.85 
 
 
386 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3173  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 
428 aa  43.9  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>