16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1659 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1659  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  870    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000022104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1537  hypothetical protein  28.57 
 
 		 448 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1071  hypothetical protein  25.5 
 
 		 380 aa  86.3  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  21.81 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  24.3 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1174  hypothetical protein  23.79 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.605378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2813  hypothetical protein  20.89 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0459  hypothetical protein  21.28 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001325  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsB  21.25 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.138283  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05206  hypothetical protein  22.88 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  20.79 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1383  hypothetical protein  20.11 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0585585  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0809  hypothetical protein  24.7 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02479  hypothetical protein  22.01 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.919961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  22.73 
 
 		 617 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  22.7 
 
 		 590 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>