22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1071 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1071  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  763    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02479  hypothetical protein  41.39 
 
 		 391 aa  305  6e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.919961  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1383  hypothetical protein  33.16 
 
 		 403 aa  195  9e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0585585  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0459  hypothetical protein  31.22 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001325  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsB  29.82 
 
 		 401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.138283  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05206  hypothetical protein  28.97 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2813  hypothetical protein  28.18 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1174  hypothetical protein  27.71 
 
 		 477 aa  131  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.605378  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1659  hypothetical protein  25.5 
 
 		 419 aa  86.3  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000022104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  23.1 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0585  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3559  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3173  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.17 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0809  hypothetical protein  21.66 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  24.26 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1537  hypothetical protein  23.02 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0459  hypothetical protein  22.58 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111213  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  23.59 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  20.47 
 
 		 451 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  20.73 
 
 		 552 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  29.63 
 
 		 590 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  28.03 
 
 		 571 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>