27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05206 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001325  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsB  74.31 
 
 		 401 aa  650    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.138283  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05206  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  847    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0459  hypothetical protein  29.8 
 
 		 398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1071  hypothetical protein  28.97 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1383  hypothetical protein  26.35 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0585585  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02479  hypothetical protein  26.6 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.919961  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1174  hypothetical protein  28.57 
 
 		 477 aa  119  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.605378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2813  hypothetical protein  24.07 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3173  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0585  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.72 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0459  hypothetical protein  24.58 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111213  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3559  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  23.78 
 
 		 617 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  21.96 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  25.17 
 
 		 590 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1659  hypothetical protein  22.88 
 
 		 419 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000022104  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  22.28 
 
 		 424 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0809  hypothetical protein  21.69 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  23.2 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  23.24 
 
 		 552 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  23.78 
 
 		 563 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  22.04 
 
 		 537 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3412  hypothetical protein  23.17 
 
 		 566 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295964  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0932  hypothetical protein  22.29 
 
 		 563 aa  44.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0523701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  21.95 
 
 		 571 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  19.5 
 
 		 451 aa  43.5  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0735  hypothetical protein  20.95 
 
 		 437 aa  43.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0886223  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>