27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2813 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2813  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  803    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1071  hypothetical protein  28.18 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02479  hypothetical protein  26.02 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.919961  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1383  hypothetical protein  24.3 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0585585  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0459  hypothetical protein  25.63 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001325  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsB  24.6 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.138283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1174  hypothetical protein  24.72 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.605378  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05206  hypothetical protein  24.07 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  22.61 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1659  hypothetical protein  20.89 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000022104  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0459  hypothetical protein  23.83 
 
 		 438 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111213  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  22.68 
 
 		 400 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  20.81 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  21.25 
 
 		 537 aa  53.9  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  23.78 
 
 		 617 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3559  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3173  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  18.64 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0585  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  18.95 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0809  hypothetical protein  21.14 
 
 		 394 aa  50.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  23.17 
 
 		 592 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1537  hypothetical protein  25.5 
 
 		 448 aa  47  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0735  hypothetical protein  25.66 
 
 		 437 aa  47  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0886223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  23.17 
 
 		 563 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  21.85 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1361  hypothetical protein  24.14 
 
 		 568 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515582  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  20.16 
 
 		 451 aa  43.9  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  22.29 
 
 		 571 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>