14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1174 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1174  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  972    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.605378  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02479  hypothetical protein  28.7 
 
 		 391 aa  133  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.919961  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1071  hypothetical protein  27.71 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1383  hypothetical protein  27.52 
 
 		 403 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0585585  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0459  hypothetical protein  25.48 
 
 		 398 aa  128  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05206  hypothetical protein  28.57 
 
 		 408 aa  120  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001325  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsB  28.12 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.138283  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2813  hypothetical protein  24.72 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1659  hypothetical protein  23.79 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000022104  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  24.22 
 
 		 592 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1537  hypothetical protein  24.15 
 
 		 448 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7239  hypothetical protein  23.41 
 
 		 528 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  24.49 
 
 		 423 aa  48.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6052  hypothetical protein  27.42 
 
 		 546 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157473  normal  0.365189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>