14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1537 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1537  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  932    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1659  hypothetical protein  28.57 
 
 		 419 aa  179  9e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000022104  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1071  hypothetical protein  23.02 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  24.57 
 
 		 451 aa  54.3  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2361  hypothetical protein  26.96 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2105  hypothetical protein  21.94 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.439369  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1383  hypothetical protein  24.59 
 
 		 403 aa  50.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0585585  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02479  hypothetical protein  26.89 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.919961  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1174  hypothetical protein  24.15 
 
 		 477 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.605378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2813  hypothetical protein  25.5 
 
 		 386 aa  47  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0459  hypothetical protein  21.79 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001325  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsB  23.05 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.138283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2474  PEP-CTERM system associated protein  23.97 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2471  hypothetical protein  23.8 
 
 		 423 aa  43.9  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>