23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2474 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2474  PEP-CTERM system associated protein  100 
 
 		 417 aa  845    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1773  hypothetical protein  90.65 
 
 		 417 aa  737    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2471  hypothetical protein  43.4 
 
 		 423 aa  339  5e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2361  hypothetical protein  38.06 
 
 		 418 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1981  hypothetical protein  37.53 
 
 		 409 aa  270  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2218  PEP-CTERM system associated protein  32.55 
 
 		 407 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0903748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0834  putative lipoprotein  29 
 
 		 420 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0685  PEP-CTERM system associated protein  27.38 
 
 		 440 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.697185 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3067  putative lipoprotein  26.58 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00656744  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2027  hypothetical protein  27.33 
 
 		 468 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0145  hypothetical protein  32.04 
 
 		 510 aa  73.9  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2389  hypothetical protein  24.26 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1519  hypothetical protein  27.22 
 
 		 496 aa  58.9  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0398559  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2526  hypothetical protein  30.34 
 
 		 528 aa  56.2  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.215866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2400  hypothetical protein  26.36 
 
 		 523 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.11617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0284  hypothetical protein  33.54 
 
 		 511 aa  53.1  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0661  hypothetical protein  22.14 
 
 		 518 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0515751  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3116  hypothetical protein  30.97 
 
 		 543 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878878  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2508  PEP-CTERM system associated protein  22.14 
 
 		 513 aa  47  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.831651 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1657  hypothetical protein  24.71 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2581  hypothetical protein  35.48 
 
 		 421 aa  46.6  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1982  hypothetical protein  35 
 
 		 501 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1537  hypothetical protein  23.97 
 
 		 448 aa  44.3  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>