13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1982 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1982  hypothetical protein  100 
 
 		 501 aa  963    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0145  hypothetical protein  41.94 
 
 		 510 aa  90.1  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1519  hypothetical protein  33.62 
 
 		 496 aa  82.4  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0398559  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2526  hypothetical protein  36.36 
 
 		 528 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.215866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2389  hypothetical protein  30.88 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2508  PEP-CTERM system associated protein  33.61 
 
 		 513 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.831651 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0284  hypothetical protein  32.79 
 
 		 511 aa  60.5  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  32.02 
 
 		 819 aa  59.3  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3116  hypothetical protein  32.35 
 
 		 543 aa  57.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1981  hypothetical protein  31.13 
 
 		 409 aa  54.3  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2471  hypothetical protein  30.7 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2400  hypothetical protein  27.1 
 
 		 523 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.11617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1773  hypothetical protein  33.98 
 
 		 417 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>