24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1981 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1981  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  840    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2361  hypothetical protein  47.42 
 
 		 418 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2474  PEP-CTERM system associated protein  38.52 
 
 		 417 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1773  hypothetical protein  37.98 
 
 		 417 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2471  hypothetical protein  36.83 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2218  PEP-CTERM system associated protein  32.44 
 
 		 407 aa  189  8e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0903748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0834  putative lipoprotein  30.9 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0685  PEP-CTERM system associated protein  29.34 
 
 		 440 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.697185 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3067  putative lipoprotein  27.8 
 
 		 440 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00656744  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2027  hypothetical protein  32 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227329 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1519  hypothetical protein  34.88 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0398559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0145  hypothetical protein  35.71 
 
 		 510 aa  70.1  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2389  hypothetical protein  22.22 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2526  hypothetical protein  20.82 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.215866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1445  hypothetical protein  25.36 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2508  PEP-CTERM system associated protein  30.28 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.831651 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0284  hypothetical protein  31.45 
 
 		 511 aa  53.5  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1982  hypothetical protein  30.63 
 
 		 501 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2400  hypothetical protein  24.84 
 
 		 523 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.11617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2966  hypothetical protein  30.65 
 
 		 561 aa  49.7  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2581  hypothetical protein  27.36 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0661  hypothetical protein  22.98 
 
 		 518 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0515751  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3116  hypothetical protein  27.78 
 
 		 543 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878878  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3279  PEP-CTERM system associated protein  28.7 
 
 		 505 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>