22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0145 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0145  hypothetical protein  100 
 
 
510 aa  1031    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2508  PEP-CTERM system associated protein  46.29 
 
 
513 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.831651 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1519  hypothetical protein  33.94 
 
 
496 aa  231  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0398559  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2526  hypothetical protein  25.84 
 
 
528 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.215866  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0284  hypothetical protein  28.77 
 
 
511 aa  169  8e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2389  hypothetical protein  28.53 
 
 
472 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2400  hypothetical protein  28.16 
 
 
523 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.11617  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0661  hypothetical protein  26.9 
 
 
518 aa  91.3  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0515751  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1982  hypothetical protein  42.28 
 
 
501 aa  90.9  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3279  PEP-CTERM system associated protein  26.48 
 
 
505 aa  84.7  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3116  hypothetical protein  26.14 
 
 
543 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2474  PEP-CTERM system associated protein  30.91 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1981  hypothetical protein  35.71 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1773  hypothetical protein  30.25 
 
 
417 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3067  putative lipoprotein  29.61 
 
 
440 aa  60.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00656744  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0834  putative lipoprotein  26.92 
 
 
420 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0685  PEP-CTERM system associated protein  27.07 
 
 
440 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.697185 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2471  hypothetical protein  25.38 
 
 
423 aa  54.7  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2361  hypothetical protein  25.75 
 
 
418 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1167  hypothetical protein  25 
 
 
536 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2218  PEP-CTERM system associated protein  24.17 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0903748  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5028  hypothetical protein  25.51 
 
 
535 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>