17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2508 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2508  PEP-CTERM system associated protein  100 
 
 		 513 aa  1041    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.831651 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0145  hypothetical protein  46.29 
 
 		 510 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1519  hypothetical protein  32.19 
 
 		 496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0398559  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0284  hypothetical protein  30.86 
 
 		 511 aa  200  6e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2526  hypothetical protein  25.2 
 
 		 528 aa  159  9e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.215866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2389  hypothetical protein  26.75 
 
 		 472 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3279  PEP-CTERM system associated protein  27.91 
 
 		 505 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2400  hypothetical protein  26.28 
 
 		 523 aa  91.3  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.11617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0661  hypothetical protein  26.84 
 
 		 518 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0515751  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3116  hypothetical protein  24.66 
 
 		 543 aa  74.7  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878878  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1982  hypothetical protein  34.17 
 
 		 501 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0685  PEP-CTERM system associated protein  27.33 
 
 		 440 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.697185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1981  hypothetical protein  30.28 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2361  hypothetical protein  26.79 
 
 		 418 aa  53.9  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5028  hypothetical protein  25.21 
 
 		 535 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0834  putative lipoprotein  23.98 
 
 		 420 aa  47  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2474  PEP-CTERM system associated protein  22.62 
 
 		 417 aa  43.5  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>