22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2361 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2361  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  855    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1981  hypothetical protein  47.42 
 
 		 409 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2474  PEP-CTERM system associated protein  38.97 
 
 		 417 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1773  hypothetical protein  39.63 
 
 		 417 aa  286  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2471  hypothetical protein  38.89 
 
 		 423 aa  269  8e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2218  PEP-CTERM system associated protein  27.14 
 
 		 407 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0903748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0834  putative lipoprotein  30.19 
 
 		 420 aa  160  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0685  PEP-CTERM system associated protein  26.48 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.697185 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3067  putative lipoprotein  26.1 
 
 		 440 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00656744  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2027  hypothetical protein  30.54 
 
 		 468 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2400  hypothetical protein  37.08 
 
 		 523 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.11617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1519  hypothetical protein  30.71 
 
 		 496 aa  58.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0398559  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0661  hypothetical protein  27.27 
 
 		 518 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0515751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2581  hypothetical protein  24.73 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2508  PEP-CTERM system associated protein  26.79 
 
 		 513 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.831651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1537  hypothetical protein  26.96 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0145  hypothetical protein  25.75 
 
 		 510 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2526  hypothetical protein  23.81 
 
 		 528 aa  51.2  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.215866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2389  hypothetical protein  25.69 
 
 		 472 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3116  hypothetical protein  24.1 
 
 		 543 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1445  hypothetical protein  22.36 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1982  hypothetical protein  29 
 
 		 501 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>