15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2218 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2218  PEP-CTERM system associated protein  100 
 
 
407 aa  831    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0903748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0834  putative lipoprotein  34.62 
 
 
420 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0685  PEP-CTERM system associated protein  33.96 
 
 
440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.697185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1981  hypothetical protein  32.68 
 
 
409 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3067  putative lipoprotein  32.37 
 
 
440 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00656744  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2471  hypothetical protein  32.49 
 
 
423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2361  hypothetical protein  27.38 
 
 
418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1773  hypothetical protein  31.9 
 
 
417 aa  152  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2474  PEP-CTERM system associated protein  31.42 
 
 
417 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2027  hypothetical protein  29.61 
 
 
468 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.227329 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2526  hypothetical protein  28.93 
 
 
528 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.215866  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0145  hypothetical protein  24.17 
 
 
510 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1519  hypothetical protein  25.27 
 
 
496 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0398559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2389  hypothetical protein  25 
 
 
472 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1982  hypothetical protein  31.58 
 
 
501 aa  43.1  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>